RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF614Q8N883 585 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF441Q8N8Z8 693 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 LRFN5Q96NI6 719 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 PHOX2BQ99453 314 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CMKLR1Q99788 373 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ULBP3Q9BZM4 244 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 WWTR1Q9GZV5 400 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CFL2Q9Y281 166 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 LYPD3O95274 346 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 IL33O95760 270 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP6V1B1P15313 513 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC5A2P31639 672 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 EMP2P54851 167 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ST3GAL3Q11203 375 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL26Q53HC5 615 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ART5Q96L15 291 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 DGCR6LQ9BY27 220 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF556Q9HAH1 456 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 MGAT4BQ9UQ53 548 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5F1O95221 314 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 IMPDH2P12268 514 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.033e-8■■■□□ 15.8
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK5R2Q13319 367 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAM2Q15035 370 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFAF6Q330K2 333 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf94Q6P1W5 598 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM205Q6UW68 189 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM198BQ6UWH4 519 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 APOOLQ6UXV4 268 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 PRR22Q8IZ63 422 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS33Q8NF86 280 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 NR4A3Q92570 626 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 C8orf44Q96CB5 159 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ING2Q9H160 280 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 COPS7AQ9UBW8 275 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC7A7Q9UM01 511 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 SAGE2PA6NJ88 616 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TO15178 435 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6B1O95007 311 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CHMP24386 653 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 GSSP48637 474 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 OR1Q1Q15612 314 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 DECR1Q16698 335 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ISXQ2M1V0 245 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 B3GNT7Q8NFL0 401 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM255BQ8WV15 326 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 SGCDQ92629 289 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CRB3Q9BUF7 120 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD19PQ9H560 264 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR54Q9H977 334 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 FMO6PO60774 539 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 RFPL3O75679 317 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CRHBPP24387 322 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 IL5RAQ01344 420 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CSRP2Q16527 193 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 UCK2Q9BZX2 261 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 SERINC4A6NH21 518 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6C76A6NM76 312 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCB7O75027 752 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CLPTM1O96005 669 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 GGT2P36268 569 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 OMPP47874 163 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 DCAF7P61962 342 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF4P78317 190 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 ILKQ13418 452 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-201ENST00000284957 CD226Q15762 336 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms