RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 SMCO1Q147U7 214 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SEC23BQ15437 767 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 C9orf152Q5JTZ5 239 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 IKBIPQ70UQ0 350 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD46Q86W74 232 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 TSSK6Q9BXA6 273 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ASB8Q9H765 288 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 POM121BA6NF01 834 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 RFXANKO14593 260 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 LAP3P28838 519 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 WNT4P56705 351 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 C4orf46Q504U0 113 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 GPR135Q8IZ08 494 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 TOMM5Q8N4H5 51 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 OR10K1Q8NGX5 313 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 OR52J3Q8NH60 311 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CHFRQ96EP1 664 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 NDOR1Q9UHB4 597 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SEMA7AO75326 666 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 NPR2P20594 1047 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SERPINA4P29622 427 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 MAPK8P45983 427 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CCR6P51684 374 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 IL2P60568 153 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CHAF1BQ13112 559 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 NFATC2Q13469 925 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CCINQ13939 588 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 TMEM255AQ5JRV8 349 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 MILR1Q7Z6M3 343 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ING5Q8WYH8 240 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 IRF7Q92985 503 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ARL6Q9H0F7 186 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 MTG2Q9H4K7 406 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 OR2M5A3KFT3 312 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CLIC1O00299 241 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 RAB36O95755 333 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CBR1P16152 277 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CRYBA2P53672 197 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SSX2Q16385 188 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 TMEM44Q2T9K0 475 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 GCNT6Q5T4J0 391 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 TMEM215Q68D42 235 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 LRRN1Q6UXK5 716 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 RNF165Q6ZSG1 346 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CHST14Q8NCH0 376 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 FAM71CQ8NEG0 241 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 MS4A4EQ96PG1 132 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 MGAT4CQ9UBM8 478 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.48■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 TMEM229AB2RXF0 380 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 LILRB5O75023 590 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 HIST1H2ABP04908 130 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 VIPR1P32241 457 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ZNF77Q15935 545 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 Q6ZVU0 165 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 OAFQ86UD1 273 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 THAP6Q8TBB0 222 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 RNF122Q9H9V4 155 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 NTMQ9P121 344 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 RHPN2P1A8MT19 583 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 OR7A17O14581 309 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 OR2A4O95047 310 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 NR2F6P10588 404 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ETV5P41161 510 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 FOXK2Q01167 660 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 HYAL1Q12794 435 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CDNFQ49AH0 187 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 Q6ZTK2 550 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SIAH3Q8IW03 269 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 STK40Q8N2I9 435 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SPPL2AQ8TCT8 520 aa20.47■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms