RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258796.11

TTYH3-201, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTYH3, Length 4,840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-201ENST00000258796 VRK2Q86Y07 508 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 ACOT4Q8N9L9 421 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 ABRACLQ9P1F3 81 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 ALX3O95076 343 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 SGSHP51688 502 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 TPRA1Q86W33 373 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 RIMKLAQ8IXN7 391 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 OR5T2Q8NGG2 359 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 CREB3L4Q8TEY5 395 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 PTCHD1Q96NR3 888 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 AKIP1Q9NQ31 210 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 GLTPQ9NZD2 209 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 EMC3Q9P0I2 261 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 C2orf74A8MZ97 194 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 TNFRSF10AO00220 468 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 ENTPD8Q5MY95 495 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 IKZF5Q9H5V7 419 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 KLRF1Q9NZS2 232 aa18.52■□□□□ 0.56
TTYH3-201ENST00000258796 C1orf105O95561 183 aa18.52■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 SHC2P98077 582 aa18.52■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 LRIF1Q5T3J3 769 aa18.52■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 FAM46BQ96A09 425 aa18.52■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 MEIS3P1A6NDR6 274 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 HOXB2P14652 356 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 HERV-K104P61576 105 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 RPS21P63220 83 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 RAB33AQ14088 237 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 DHCR24Q15392 516 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 ARL11Q969Q4 196 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 ASB1Q9Y576 335 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 AMY2BP19961 511 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 RAP2BP61225 183 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 KRBOX4Q5JUW0 171 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 NKAPLQ5M9Q1 402 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 LDLRAD1Q5T700 205 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 ALKAL2Q6UX46 152 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 APOOLQ6UXV4 268 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 C12orf40Q86WS4 652 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF283Q8N7M2 679 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF565Q8N9K5 539 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 OR13C3Q8NGS6 347 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 MED30Q96HR3 178 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 CAPNS2Q96L46 248 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 V9GY05 133 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 NPIPA7E9PJI5 369 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 ADH1BP00325 375 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 CSF1P09603 554 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 NPIPA8P0DM63 369 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 HBMQ6B0K9 141 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 CSNK1A1LQ8N752 337 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 PEX14O75381 377 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 MCEMP1Q8IX19 187 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 MRI1Q9BV20 369 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 RLIMQ9NVW2 624 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 PPT2Q9UMR5 302 aa18.51■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 A0A1W2PPL8 197 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 A0A1W2PQU0 124 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 H7C417 338 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 RFLNAQ6ZTI6 216 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 CDRT4Q8N9R6 151 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 GAL3ST3Q96A11 431 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 LINC00597Q9H2U6 94 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 RAD1O60671 282 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 DCNP07585 359 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 DLSTP36957 453 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 PSPHP78330 225 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 SLC7A13Q8TCU3 470 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 ELP5Q8TE02 316 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 HSFX1Q9UBD0 423 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 MMP2P08253 660 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 RNH1P13489 461 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 SHC1P29353 583 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 TMEM150AQ86TG1 271 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 GPR148Q8TDV2 347 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 ASIC5Q9NY37 505 aa18.5■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 C1orf196B1AJZ1 125 aa18.49■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 PLGP00747 810 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 FURINP09958 794 aa18.49■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 TRAPPC2P0DI81 140 aa18.49■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 TRAPPC2BP0DI82 140 aa18.49■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 CD1EP15812 388 aa18.49■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 FUT1P19526 365 aa18.49■□□□□ 0.55
TTYH3-201ENST00000258796 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms