RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.93□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 CCDC58Q4VC31 144 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 NIPAL3Q6P499 406 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CFAP77Q6ZQR2 320 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CLECL1Q8IZS7 167 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa9.93□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 OR51L1Q8NGJ5 315 aa9.93□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 NFS1Q9Y697 457 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 SLC18A1P54219 525 aa9.93□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 HTR1EP28566 365 aa9.93□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.93□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.93□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 SDHBP21912 280 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 MTNR1AP48039 350 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 FGL1Q08830 312 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 LTC4SQ16873 150 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM244Q5VVB8 128 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 PIGWQ7Z7B1 504 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 OR7G3Q8NG95 312 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.92□□□□□ -0.82
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