RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp101Q8BP18 612 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Coq9Q8K1Z0 313 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Colec12Q8K4Q8 742 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mapre2Q8R001 326 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ash2lQ91X20 623 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TympQ99N42 471 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnase1l1Q9D7J6 314 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prss16Q9QXE5 509 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr4a3Q9QZB6 627 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sema4gQ9WUH7 837 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4932443I19RikA0A286YE38 169 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem74bA2AU34 232 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Otud4B2RRE7 1107 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc9a5B2RXE2 898 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp395E9Q5N9 508 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EmdO08579 259 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd83O88324 196 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cntn1P12960 1020 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ypel5P62700 121 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SctQ08535 133 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem217Q14AF1 189 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nell1Q2VWQ2 810 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ugt2b36Q3UEP4 530 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taar2Q5QD17 339 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xrcc1Q60596 631 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lamp3Q7TST5 411 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim23Q8BGX0 574 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cnot2Q8C5L3 540 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr170Q8VGL6 313 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr572Q8VGZ3 318 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhac1Q91Y10 964 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Exosc1Q9DAA6 195 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cmpk1Q9DBP5 196 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd302Q9DCG2 228 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr88Q9EPB7 384 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ascl3Q9JJR7 174 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csnk1eQ9JMK2 416 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HraslsQ9QZU4 167 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec2iQ9WVF9 217 aa11.84□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm29797A0A140LIA7 188 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5072A2AHM1 344 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 G430095P16RikE9Q913 147 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc7bE9Q9Y3 381 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DdostO54734 441 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nid1P10493 1245 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl7P14148 270 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hmgn1P18608 96 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myf5P24699 255 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc6a12P31651 614 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FahP35505 419 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Etv1P41164 477 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adra2aQ01338 450 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxd1Q01822 328 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atg4bQ8BGE6 393 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcaf12l2Q8BGW4 469 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a24Q8BMD8 475 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sdhaf3Q8BQU3 125 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc5a8Q8BYF6 611 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1020Q8VFK7 317 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acot7Q91V12 381 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrgprb4Q91ZC0 321 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrch4Q921G6 680 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uck2Q99PM9 261 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Etv5Q9CXC9 510 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eral1Q9CZU4 437 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HhatlQ9D1G3 503 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trappc4Q9ES56 219 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nfkb2Q9WTK5 899 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TectaO08523 2155 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcaf4A0A1Y7VNZ0 532 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FcmrA1KXC4 422 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6710A2ART0 554 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm14744B1AVU4 173 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm609E9Q573 300 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Best1O88870 551 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AboP38649 332 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcbp3P57722 371 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab2bP59279 216 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snrpd2P62317 118 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmprss11cQ1JRP2 431 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nkx6-3Q3UHX8 262 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc47a2Q3V050 573 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm527Q4KL13 310 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spin1Q61142 262 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a12Q8BH59 677 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp6v1hQ8BVE3 483 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptges2Q8BWM0 384 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ska3Q8C263 411 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem200aQ8C817 491 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ffar2Q8VCK6 330 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 5430402E10RikQ9D3N5 173 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nacc2Q9DCM7 586 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ReckQ9Z0J1 971 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mbd4Q9Z2D7 554 aa11.83□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm44973A0A140LJJ1 189 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sult3a2G5E904 293 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17026K7N6Z0 213 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r20K7N778 303 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gosr2O35166 212 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2j5O54749 501 aa11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.8 ms