RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637100.1

CLN3-255, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-255ENST00000637100 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.68□□□□□ -0.06
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CLN3-255ENST00000637100 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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CLN3-255ENST00000637100 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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CLN3-255ENST00000637100 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.67□□□□□ -0.06
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CLN3-255ENST00000637100 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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CLN3-255ENST00000637100 SLC29A2Q14542 456 aa14.67□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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CLN3-255ENST00000637100 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.65□□□□□ -0.06
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CLN3-255ENST00000637100 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.64□□□□□ -0.07
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CLN3-255ENST00000637100 CCDC126Q96EE4 140 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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CLN3-255ENST00000637100 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 EMCNQ9ULC0 261 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN3-255ENST00000637100 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.63□□□□□ -0.07
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