RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	RFK	Q969G6	155 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF649	Q9BS31	505 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	RNF122	Q9H9V4	155 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ZFP57	Q9NU63	452 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	RASD1	Q9Y272	281 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958		A0A1B0GTQ1	180 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SCAMP1	O15126	338 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	WNT1	P04628	370 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	UROD	P06132	367 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	OR12D1	P0DN82	309 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SPP1	P10451	314 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CSF2RA	P15509	400 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	GSTM3	P21266	225 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SOX18	P35713	384 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	STAT5A	P42229	794 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	DLX5	P56178	289 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	NFATC2	Q13469	925 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SERTAD2	Q14140	314 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MPPED2	Q15777	294 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	COX20	Q5RI15	118 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	METTL23	Q86XA0	190 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	EBPL	Q9BY08	206 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CHIA	Q9BZP6	476 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	NTM	Q9P121	344 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	OPN4	Q9UHM6	478 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TTC3	P53804	2025 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CD8B2	A6NJW9	211 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	C5orf58	C9J3I9	102 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM227A	F5H4B4	570 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	RNF13	O43567	381 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MT-ND4	P03905	459 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF806	P0C7X5	589 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CD8B	P10966	210 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MGMT	P16455	207 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CNR1	P21554	472 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC6A12	P48065	614 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	DGCR2	P98153	550 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF124	Q15973	351 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	STX12	Q86Y82	276 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MEIOB	Q8N635	442 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TEX19	Q8NA77	164 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	VOPP1	Q96AW1	172 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CA10	Q9NS85	328 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958		A0A0C4DFX4	3053 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958		A0A0G2JK05	382 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM218	A2RU14	115 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SIX6	O95475	246 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	GP1BA	P07359	652 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF3	P17036	446 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MAPK9	P45984	424 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CTSC	P53634	463 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ZXDB	P98169	803 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	BCL2L1	Q07817	233 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ARHGEF7	Q14155	803 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	LIPJ	Q5W064	366 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	FUT10	Q6P4F1	479 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SPRED2	Q7Z698	418 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MFRP	Q9BY79	579 aa		10.04	□□□□□ -0.8

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