RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 SLC29A2Q14542 456 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 FRMD7Q6ZUT3 714 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 OR4C3Q8NH37 302 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 HHATLQ9HCP6 504 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ADAMDEC1O15204 470 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFB5O43674 189 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 CRCPO75575 148 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 NGFRP08138 427 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 VPS26BQ4G0F5 336 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 SLC9A6Q92581 669 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 NPAS1Q99742 590 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 PRR14LQ5THK1 2151 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 C7orf72A4D263 438 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 PDPK1O15530 556 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 SEC22BO75396 215 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 PRPH2P23942 346 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 NR1H2P55055 460 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 RAC1P63000 192 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 GALNT10Q86SR1 603 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 CNPY4Q8N129 248 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 CDRT4Q8N9R6 151 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 CEP70Q8NHQ1 597 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 FAM110BQ8TC76 370 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB8AQ96BR9 441 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 GLRX2Q9NS18 164 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 NTMQ9P121 344 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 NPIPB8E9PQR5 432 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 CXCL13O43927 109 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 PLAUP00749 431 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 OPN1LWP04000 364 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 PROCP04070 461 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 UROSP10746 265 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 GPC1P35052 558 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJB13P59910 316 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 PLPPR5Q32ZL2 321 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 CPTPQ5TA50 214 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 BEND4Q6ZU67 534 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 OR2V1Q8NHB1 315 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ACTRT2Q8TDY3 377 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM171Q8WVE6 324 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 FANCFQ9NPI8 374 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 TBK1Q9UHD2 729 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PPM1 405 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PRB8 838 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 GLRA3O75311 464 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 SYNGR4O95473 234 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 PRKAG1P54619 331 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 SLC18A2Q05940 514 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 CFAP157Q5JU67 520 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 GATSQ8NAP1 163 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 SLC16A11Q8NCK7 471 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 NUP43Q8NFH3 380 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 GIMAP5Q96F15 307 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 PLPPR2Q96GM1 343 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 RNF145Q96MT1 663 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM204Q9BSN7 226 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ACTR6Q9GZN1 396 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 OR10A4Q9H209 315 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 MED17Q9NVC6 651 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf109Q9NX04 203 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 FBN3Q75N90 2809 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 INAFM1C9JVW0 142 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 TNFSF11O14788 317 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 TBX19O60806 448 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 TMCC2O75069 709 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 KCNK2O95069 426 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ACP2P11117 423 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ATRQ13535 2644 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF385BQ569K4 471 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 FIGNL1Q6PIW4 674 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ZAR1Q86SH2 424 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 STK32CQ86UX6 486 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF611Q8N823 705 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 OR6Y1Q8NGX8 325 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ZFP28Q8NHY6 868 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 FCRL1Q96LA6 429 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 MDFIQ99750 246 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
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