RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM23P36406 574 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CD96P40200 585 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 GCGRP47871 477 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB28P51157 221 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CTBP2P56545 445 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 HOXC5Q00444 222 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 DUSP8Q13202 625 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 AGERQ15109 404 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 P2RY14Q15391 338 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ZIC1Q15915 447 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SYPL1Q16563 259 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ISXQ2M1V0 245 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CDONQ4KMG0 1287 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 METRNLQ641Q3 311 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC48A1Q6P1K1 146 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 RFLNAQ6ZTI6 216 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 GAREM2Q75VX8 874 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2L5Q8NG80 312 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2L8Q8NGY9 312 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5W2Q8NH69 310 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 GANCQ8TET4 914 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB8BQ92930 207 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 OMA1Q96E52 524 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 COX14Q96I36 57 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF649Q9BS31 505 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TIMM29Q9BSF4 260 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 DPH7Q9BTV6 452 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ACAT2Q9BWD1 397 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 VN1R3Q9BXE9 311 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2AG1Q9H205 316 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CREBZFQ9NS37 354 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TDP1Q9NUW8 608 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 NUDT15Q9NV35 164 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 DPP7Q9UHL4 492 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF222Q9UK12 451 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 PRELID1Q9Y255 219 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ETV7Q9Y603 341 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A0X1KG70 313 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 LRIT2A6NDA9 550 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 A6NL46 340 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM227AF5H4B4 570 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GABARAPH6UMI1 98 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 SAP18O00422 153 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF432O94892 652 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 EGFP01133 1207 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GBAP04062 536 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CHRM4P08173 479 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2T7P0C7T2 308 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CALCBP10092 127 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 ZP3P21754 424 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PRKACBP22694 351 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFS1P28331 727 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 CALCRP30988 508 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 BMP8BP34820 402 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 EVI2BP34910 448 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-202ENST00000586851 GATMP50440 423 aa7.21□□□□□ -1.26
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