RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580948.1

LINC00511-211, long intergenic non-protein coding RNA 511, humanhuman

TSL 3

Gene LINC00511, Length 475 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00511-211ENST00000580948 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 OR5M9Q8NGP3 310 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 GTF2H4Q92759 462 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 C14orf79Q96F83 325 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CHMP6Q96FZ7 201 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 SLC35G5Q96KT7 338 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 PANX1Q96RD7 426 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 SDF2Q99470 211 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 SLC35A5Q9BS91 424 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 LDAHQ9H6V9 325 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 MEMO1Q9Y316 297 aa8.4□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 FREM3P0C091 2139 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 MTORP42345 2549 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 A0A0G2JND7 137 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 DUXAA6NLW8 204 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 NPIPA7E9PJI5 369 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 E9PLN8 166 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 C19orf84I3L1E1 186 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 HMGN4O00479 90 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 RFXANKO14593 260 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 PRRG2O14669 202 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 BCKDKO14874 412 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 TRAPPC6AO75865 159 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ANGPTL1O95841 491 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ZCCHC18P0CG32 403 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 NPIPA8P0DM63 369 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 OR12D1P0DN82 309 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 SRD5A2P31213 254 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 MVDP53602 400 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 KRTAP10-9P60411 292 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 TLE4Q04727 773 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 FUT5Q11128 374 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 STX5Q13190 355 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 SQLEQ14534 574 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 CD226Q15762 336 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 GTDC1Q4AE62 458 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 GXYLT1Q4G148 440 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 KLHL26Q53HC5 615 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 COX20Q5RI15 118 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 DCST1Q5T197 706 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 AP1ARQ63HQ0 302 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 VASNQ6EMK4 673 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 RNF130Q86XS8 419 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 OR2M3Q8NG83 312 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 RAB8BQ92930 207 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ITCHQ96J02 903 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 SIKE1Q9BRV8 207 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 OR51I1Q9H343 314 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 DSN1Q9H410 356 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 EXO5Q9H790 373 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 MCCC2Q9HCC0 563 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 MED11Q9P086 117 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.39□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 A0A1W2PQD3 144 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 NR5A2O00482 541 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 OIP5O43482 229 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 FCMRO60667 390 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 AK1P00568 194 aa8.38□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 VIMP08670 466 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms