RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557168.1

TRAV30-201, Transcript of T cell receptor alpha variable 30, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRAV30, Length 337 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV30-201ENST00000557168 SLC9A5Q14940 896 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 LAPTM4AQ15012 233 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SF1Q15637 639 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 MAPK11Q15759 364 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 OCLNQ16625 522 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SLC5A12Q1EHB4 618 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CATSPEREQ5SY80 951 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SLX4IPQ5VYV7 408 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 C12orf73Q69YU5 71 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PLAG1Q6DJT9 500 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 REEP3Q6NUK4 255 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 AHSA2Q719I0 299 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 COMMD6Q7Z4G1 85 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 VN1R5Q7Z5H4 357 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 MRGPREQ86SM8 312 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CCDC190Q86UF4 302 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PLD3Q8IV08 490 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ZNF547Q8IVP9 402 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 LGI4Q8N135 537 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 KRT78Q8N1N4 520 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 GALNT16Q8N428 558 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 LINC00471Q8N535 108 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 KBTBD8Q8NFY9 601 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 OR2L2Q8NH16 312 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 MCFD2Q8NI22 146 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SPPL2AQ8TCT8 520 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SLC5A11Q8WWX8 675 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PIK3R3Q92569 461 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 NRGNQ92686 78 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 MAL2Q969L2 176 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PPCDCQ96CD2 204 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TM4SF18Q96CE8 201 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CLIP3Q96DZ5 547 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 COX14Q96I36 57 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TXNDC15Q96J42 360 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TPD52L3Q96J77 140 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 Q96MT0 163 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 QRFPRQ96P65 431 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 KCNC2Q96PR1 638 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 RHNO1Q9BSD3 238 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CCDC32Q9BV29 185 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 KLHL25Q9H0H3 589 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PCBD2Q9H0N5 130 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 OR2AG1Q9H205 316 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 OR52A5Q9H2C5 316 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ARMC7Q9H6L4 198 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 RUBCNLQ9H714 662 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ZNF556Q9HAH1 456 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PELI2Q9HAT8 420 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 C3orf14Q9HBI5 128 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 BCL2L10Q9HD36 194 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 WASH6PQ9NQA3 447 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SEMA3GQ9NS98 782 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 RLIMQ9NVW2 624 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 QPCTLQ9NXS2 382 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 KIF17Q9P2E2 1029 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 REV1Q9UBZ9 1251 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 DAPK2Q9UIK4 370 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TCFL5Q9UL49 500 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 MGAT4BQ9UQ53 548 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ANGPT4Q9Y264 503 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 IFT52Q9Y366 437 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 JMJD1CQ15652 2540 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 DNHD1Q96M86 4753 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 A0A0G2JNG1 304 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TRBC2A0A5B9 178 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 KRT87PA6NCN2 255 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 OR2AG2A6NM03 316 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 MEN1O00255 615 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 FAAHO00519 579 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CCL21O00585 134 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 FFAR1O14842 300 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms