RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 FGFBP1Q14512 234 aa13.66□□□□□ -0.22
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM44Q2T9K0 475 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FIGNL1Q6PIW4 674 aa13.66□□□□□ -0.22
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 C1orf50Q9BV19 199 aa13.66□□□□□ -0.22
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GIMAP2Q9UG22 337 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP13.66□□□□□ -0.22
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A1W2PQD3 144 aa13.65□□□□□ -0.22
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCDO00767 359 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TNFSF13O75888 250 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYZAPP0CAP1 466 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF17P17021 662 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 C21orf58P58505 322 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPDYE7PQ495Y7 208 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BHLHB9Q6PI77 547 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLXDC2Q6UX71 529 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LUZP2Q86TE4 346 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RIMKLAQ8IXN7 391 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC01560Q8TB33 94 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO30Q8TB52 745 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHMP6Q96FZ7 201 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DOCK7Q96N67 2140 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DACH2Q96NX9 599 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 YIPF4Q9BSR8 244 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PINK1Q9BXM7 581 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACTRT3Q9BYD9 372 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HOXD1Q9GZZ0 328 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NEUROD4Q9HD90 331 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GALNT8Q9NY28 637 aa13.65□□□□□ -0.22
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAB21Q9UL25 225 aa13.65□□□□□ -0.22
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C7orf72A4D263 438 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SEC14L5O43304 696 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FCGR2AP12318 317 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP6V1C1P21283 382 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ART1P52961 327 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLDN8P56748 225 aa13.64□□□□□ -0.23
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHI3L2Q15782 390 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXW10Q5XX13 1052 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDC73Q6P1J9 531 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAMKMTQ7Z624 323 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GALNT10Q86SR1 603 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDC20BQ86Y33 519 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 METTL25Q8N6Q8 603 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF527Q8NB42 609 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR5M1Q8NGP8 315 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SFXN5Q8TD22 340 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADAMTS15Q8TE58 950 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB8AQ96BR9 441 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STARD4Q96DR4 205 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DUSP26Q9BV47 211 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF122Q9H9V4 155 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NDRG3Q9UGV2 375 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAP2CQ9Y3L5 183 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACTL7BQ9Y614 415 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR91A4D1P6 747 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H3BNH8 94 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CASKO14936 926 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CFLARO15519 480 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ITM2AO43736 263 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C6orf47O95873 294 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DHRS4L1P0CG22 281 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 G6PDP11413 515 aa13.63□□□□□ -0.23
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 IST1P53990 364 aa13.63□□□□□ -0.23
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