RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1B0GTH9 108 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 FIGNL2A6NMB9 653 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 C5orf58C9J3I9 102 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV1D-16P01601 117 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 DRD4P21917 467 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 CHMP24386 653 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 DPP4P27487 766 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 GAS1P54826 345 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS26P62854 115 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR68Q15743 365 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 NHSL2Q5HYW2 709 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 CCNJQ5T5M9 372 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 BICRALQ6AI39 1079 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM211Q6ICI0 200 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 ARPINQ7Z6K5 226 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 DHDDSQ86SQ9 333 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 MARCH3Q86UD3 253 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 IFNEQ86WN2 208 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 CLEC4FQ8N1N0 589 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 FADS6Q8N9I5 356 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 WDSUB1Q8N9V3 476 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM57AQ8TBR7 257 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 PIGQQ9BRB3 760 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 SPATA9Q9BWV2 254 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2B2Q9GZK3 357 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC52A3Q9NQ40 469 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 TAS2R10Q9NYW0 307 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 ACAD8Q9UKU7 415 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 OSGIN2Q9Y236 505 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 BSNQ9UPA5 3926 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 AHRRA9YTQ3 701 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA0513O60268 411 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR1O75083 606 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 PDE9AO76083 593 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 DBIP07108 87 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 BMP2P12643 396 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 UQCRBP14927 111 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 GPX2P18283 190 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF1P41567 113 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 RBBP4Q09028 425 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 C4orf17Q53FE4 359 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 PAGE3Q5JUK9 113 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 FNDC7Q5VTL7 733 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 KRT73Q86Y46 540 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM26EQ8N5C1 309 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKS4BQ8N8V4 417 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2M3Q8NG83 312 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB8BQ92930 207 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 RELTQ969Z4 430 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB8AQ96BR9 441 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD27Q96NW4 1050 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 DSN1Q9H410 356 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 EVA1AQ9H8M9 152 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 EFCAB1Q9HAE3 211 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 A4GALTQ9NPC4 353 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM53CQ9NYF3 392 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 IFT52Q9Y366 437 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNE3Q9Y6H6 103 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 SERINC4A6NH21 518 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 NPIPB9F8W1W9 429 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF264O43296 627 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 HCRTR2O43614 444 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 H6PDO95479 791 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM107AO95990 144 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 TPOP07202 933 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 RFPL3SP0C7P2 107 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 UBL4AP11441 157 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 IL7RP16871 459 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC6A2P23975 617 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 PRDX6P30041 224 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 CA7P43166 264 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC6A8P48029 635 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 P2RX1P51575 399 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 BCL2A1Q16548 175 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 RUNDC3AQ59EK9 446 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-208ENST00000504294 GCNT6Q5T4J0 391 aa13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms