RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 AK1P00568 194 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SOD3P08294 240 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TTKP33981 857 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SERPINB4P48594 390 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CHN2P52757 468 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PDE7AQ13946 482 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 OR10D3Q8NH80 312 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SFXN5Q8TD22 340 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 JMJD8Q96S16 334 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 DESI2Q9BSY9 194 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 NMUR2Q9GZQ4 415 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 IPPKQ9H8X2 491 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 EMC3Q9P0I2 261 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 A0A0G2JN53 185 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 OR5H1A6NKK0 313 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 TCF21O43680 179 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF23P17027 643 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 NR4A2P43354 598 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 DR1Q01658 176 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 PON3Q15166 354 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 POC1BQ8TC44 478 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 ITPR3Q14573 2671 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 DSCAMO60469 2012 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 A0A0G2JK05 382 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 DPRXA6NFQ7 191 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD28O15084 1053 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 LMX1BO60663 402 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 SUPT3HO75486 399 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 KCNH1O95259 989 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 PMS2P2O95744 297 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 KRT6AP02538 564 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 KRT6BP04259 564 aa6.83□□□□□ -1.32
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PDE4D-210ENST00000503258 KRT6CP48668 564 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 ID2Q02363 134 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 PPA1Q15181 289 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 SMU1Q2TAY7 513 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 S100PBPQ96BU1 408 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 CFAP36Q96G28 342 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 BEX2Q9BXY8 128 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 MALT1Q9UDY8 824 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 SVILO95425 2214 aa6.83□□□□□ -1.32
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PDE4D-210ENST00000503258 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa6.83□□□□□ -1.32
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PDE4D-210ENST00000503258 REM1O75628 298 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 UTS2O95399 124 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 GSTA1P08263 222 aa6.83□□□□□ -1.32
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PDE4D-210ENST00000503258 CCNG1P51959 295 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 FAM168AQ92567 244 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 KAT2AQ92830 837 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 LIPT1Q9Y234 373 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-210ENST00000503258 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.83□□□□□ -1.32
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