RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf47	O95873	294 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	NGFR	P08138	427 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP4B1	P13584	511 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	SOAT1	P35610	550 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	GAB1	Q13480	694 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	TOMM20	Q15388	145 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNE	Q86WN2	208 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	FADS6	Q8N9I5	356 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	SFXN5	Q8TD22	340 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	WNT2B	Q93097	391 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	MARK4	Q96L34	752 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	EBF4	Q9BQW3	602 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	EQTN	Q9NQ60	294 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	SERHL	Q9NQF3	203 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		15.69	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD28	O15084	1053 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	NKX2-2	O95096	273 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNH1	O95259	989 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	PGR	P06401	933 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CRH	P06850	196 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ALOX5	P09917	674 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CTSS	P25774	331 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	EVI2B	P34910	448 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP4B	P51164	291 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ARFIP2	P53365	341 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	DESI1	Q6ICB0	168 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ARSK	Q6UWY0	536 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF18B	Q86Y91	864 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR151	Q8TDV0	419 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF559	Q9BR84	538 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	JKAMP	Q9P055	326 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		15.68	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM234B	A2RU67	622 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM221A	A4D161	298 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ZIC3	O60481	467 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	RCBTB2	O95199	551 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	PEPD	P12955	493 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	UQCRC2	P22695	453 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	GABRA3	P34903	492 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	HBA1	P69905	142 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	SORD	Q00796	357 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	SQLE	Q14534	574 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC9A6	Q92581	669 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	JADE3	Q92613	823 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	PANX1	Q96RD7	426 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	DUXA	A6NLW8	204 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ANP32D	O95626	131 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF708	P17019	499 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	DPP4	P27487	766 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	LHX2	P50458	406 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	DGKQ	P52824	942 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	DLX5	P56178	289 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD46	Q86W74	232 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM110B	Q8TC76	370 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM222B	Q8WU58	562 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT8	Q8WV74	236 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ITCH	Q96J02	903 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX37	Q96LM6	180 aa		15.66	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		15.66	■□□□□ 0.1

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