RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	SZRD1	Q7Z422	152 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	TDRP	Q86YL5	185 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	NUP43	Q8NFH3	380 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	MED18	Q9BUE0	208 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	PRR14	Q9BWN1	585 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	REEP4	Q9H6H4	257 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF175	Q9Y473	711 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		10.69	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	ALG1L2	C9J202	215 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC28A1	O00337	649 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	OIP5	O43482	229 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	KCNK2	O95069	426 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	KCNH1	O95259	989 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	THBD	P07204	575 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	BCKDHA	P12694	445 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	FOSL1	P15407	271 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	IL11	P20809	199 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	SHC1	P29353	583 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	ARRB2	P32121	409 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	GPC1	P35052	558 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC18A2	Q05940	514 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	PDE7A	Q13946	482 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	CD226	Q15762	336 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	GALNTL6	Q49A17	601 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	KANK2	Q63ZY3	851 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	POC1B	Q8TC44	478 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM110B	Q8TC76	370 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	PPCDC	Q96CD2	204 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	ADGRG7	Q96K78	797 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	CCT7	Q99832	543 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	MECR	Q9BV79	373 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	NTM	Q9P121	344 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	JMJD1C	Q15652	2540 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269		A0A0J9YW62	118 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269		A0A1W2PRB8	838 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	C16orf97	H3BN30	126 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269		H3BQF6	201 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	LINC01387	J3KSC0	135 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	RGS14	O43566	566 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	NDUFB5	O43674	189 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	CXCL13	O43927	109 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	TBX19	O60806	448 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	IFI6	P09912	130 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	NPIPA8	P0DM63	369 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	CD8B	P10966	210 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	TBXA2R	P21731	343 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	ALDH3A1	P30838	453 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	KCNJ5	P48544	419 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	LTB	Q06643	244 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	SGCB	Q16585	318 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	OR10D3	Q8NH80	312 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	AGR3	Q8TD06	166 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF524	Q96C55	264 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
FAM204A-208	ENST00000487269	C18orf12	Q96KH6	178 aa		10.67	□□□□□ -0.7

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