RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 WASHC1A8K0Z3 465 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 H7C1Q1 480 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 AKAP10O43572 662 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 OR10H2O60403 315 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 ERN1O75460 977 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 GOSR1O95249 250 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 FGF4P08620 206 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP6V1B1P15313 513 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 ERFP50548 548 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC12A2P55011 1212 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 IRF9Q00978 393 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 TNFRSF17Q02223 184 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 FOXF2Q12947 444 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 RPS6KA2Q15349 733 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 OR4D1Q15615 310 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 FNDC7Q5VTL7 733 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 REP15Q6BDI9 236 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 OR4C11Q6IEV9 310 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 SULT1C3Q6IMI6 304 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 AMIGO2Q86SJ2 522 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 LUZP2Q86TE4 346 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 RNF175Q8N4F7 328 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 RIT1Q92963 219 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 EXT2Q93063 718 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP6V1E2Q96A05 226 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 SLCO4A1Q96BD0 722 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 L3HYPDHQ96EM0 354 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 TSPAN17Q96FV3 270 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 WDYHV1Q96HA8 205 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 COX4I2Q96KJ9 171 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 DACH2Q96NX9 599 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 CAB39LQ9H9S4 337 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 MS4A12Q9NXJ0 267 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-207ENST00000484547 GLOD5A6NK44 160 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 H0YAE9 185 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 UBDO15205 165 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 IL18BPO95998 194 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 NPPAP01160 153 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 CLPSP04118 112 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 PORP16435 677 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 SOX18P35713 384 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 BIKQ13323 160 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 RCAN2Q14206 197 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 FXNQ16595 210 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM83EQ2M2I3 478 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC36A3Q495N2 470 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 TECRLQ5HYJ1 363 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 C6orf10Q5SRN2 563 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 MED27Q6P2C8 311 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 DHFR2Q86XF0 187 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 HOMEZQ8IX15 550 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 SPPL2AQ8TCT8 520 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 UBE2E3Q969T4 207 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 CMTM7Q96FZ5 175 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 ANGPTL4Q9BY76 406 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 CALHM2Q9HA72 323 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 POPDC3Q9HBV1 291 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 TBC1D23Q9NUY8 699 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 ACTR3BQ9P1U1 418 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 XPR1Q9UBH6 696 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF639Q9UID6 485 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 PHF11Q9UIL8 331 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 TTC36A6NLP5 189 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 OR6C76A6NM76 312 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 GNB5O14775 395 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 CASKO14936 926 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 CFLARO15519 480 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 SMPD2O60906 423 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 SNX4O95219 450 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 ESRRBO95718 433 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 GPR75O95800 540 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 S100BP04271 92 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 CYP4B1P13584 511 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 CD1DP15813 335 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 SSTR4P31391 388 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 CASP2P42575 452 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 TMBIM6P55061 237 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 PKNOX1P55347 436 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 ACAP2Q15057 778 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 CDKL4Q5MAI5 379 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154 ms