RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 CHMP24386 653 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 RPS26P62854 115 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 SRYQ05066 204 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 MISPQ8IVT2 679 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 GATSQ8NAP1 163 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC115Q96NT0 180 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC35A5Q9BS91 424 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ZIM2Q9NZV7 527 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 MED12Q93074 2177 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1W2PQD3 144 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 H3BNH8 94 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 GMFGO60234 142 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 CPN1P15169 458 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 MSX1P28360 303 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 GRNP28799 593 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 DCTP40126 519 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 STARP49675 285 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 GFRA1P56159 465 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 STX1BP61266 288 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 FLYWCH1Q4VC44 716 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 DCST1Q5T197 706 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ATAD3BQ5T9A4 648 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 RAET1LQ5VY80 246 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF787Q6DD87 383 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF621Q6ZSS3 439 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 C16orf62Q7Z3J2 963 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 MIER2Q8N344 545 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 LILRB4Q8NHJ6 448 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 XAGE5Q8WWM1 108 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIB1Q96RU8 372 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 OR51I1Q9H343 314 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 RUBCNLQ9H714 662 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 TCF7L2Q9NQB0 619 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 CACNA1CQ13936 2221 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC154A6NI56 674 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 HSPB2A8KAH6 182 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 H0Y3Z8 333 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 IL2RAP01589 272 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 IDH3AP50213 366 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP12AP54707 1039 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 AQP5P55064 265 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 CASP9P55211 416 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 CDSNQ15517 529 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 HSPB2Q16082 182 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 CHMP1BQ7LBR1 199 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 LACC1Q8IV20 430 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ZPLD1Q8TCW7 415 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 MIPOL1Q8TD10 442 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 SDF2Q99470 211 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 PIGQQ9BRB3 760 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC28BQ9BUN5 200 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 RMND5AQ9H871 391 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNJ16Q9NPI9 418 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0G2JNJ9 132 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM90A27PA6NNH2 459 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 B4DXG7 233 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 NPIPA7E9PJI5 369 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 LINC01387J3KSC0 135 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 RFXANKO14593 260 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 STX11O75558 287 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ANP32DO95626 131 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 NPIPA8P0DM63 369 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 OR12D1P0DN82 309 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 PEPDP12955 493 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 KHKP50053 298 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 SAXO2Q658L1 398 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF614Q8N883 585 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 NEURL3Q96EH8 262 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 INPP5KQ9BT40 448 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 SERHL2Q9H4I8 314 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 CALHM2Q9HA72 323 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 STOML1Q9UBI4 398 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 Q9UFV3 132 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 CD8B2A6NJW9 211 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 GSNP06396 782 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 TIMP3P35625 211 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ADH7P40394 386 aa17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms