RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470268.1

SF3B1-208, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, human

TSL 2

Gene SF3B1, Length 2,003 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3B1-208	ENST00000470268	ACTR3	P61158	418 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	SSPN	Q14714	243 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	ADRM1	Q16186	407 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	CT83	Q5H943	113 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	SAXO2	Q658L1	398 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	TMEM64	Q6YI46	380 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	RNF130	Q86XS8	419 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	FBXO30	Q8TB52	745 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	NEURL3	Q96EH8	262 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF583	Q96ND8	569 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268		H3BNX3	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	NKX2-8	O15522	239 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	EMC8	O43402	210 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	APOL3	O95236	402 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	IL18BP	O95998	194 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	CYC1	P08574	325 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	CT45A8	P0DMV1	189 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	CT45A9	P0DMV2	189 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC26A5	P58743	744 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	PSG6	Q00889	435 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268		Q0VFX4	171 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	FUT5	Q11128	374 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	BIK	Q13323	160 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	RGN	Q15493	299 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	MAPK11	Q15759	364 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	OR10A6	Q8NH74	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	FGF11	Q92914	225 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	RAB8B	Q92930	207 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SF3B1-208	ENST00000470268	MAL2	Q969L2	176 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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