RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468069.1

RPS6KC1-203, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KC1, Length 784 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-203ENST00000468069 CDK9P50750 372 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 LIM2P55344 173 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 DMTNQ08495 405 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 FAM27E3Q08E93 113 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 TNK1Q13470 666 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 CCNIQ14094 377 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 MLC1Q15049 377 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 EIPR1Q53HC9 387 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 SEL1L2Q5TEA6 688 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 ANKRD22Q5VYY1 191 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 ADNP2Q6IQ32 1131 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 RAD9BQ6WBX8 426 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 RINLQ6ZS11 566 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 C9orf40Q8IXQ3 194 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC22A8Q8TCC7 542 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 PAQR8Q8TEZ7 354 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF721Q8TF20 911 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 FBXL8Q96CD0 374 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 MS4A6EQ96DS6 147 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 HES6Q96HZ4 224 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF597Q96LX8 424 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 QRFPRQ96P65 431 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 FAM111AQ96PZ2 611 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 F2RL3Q96RI0 385 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 PIP5K1AQ99755 562 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 MED18Q9BUE0 208 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 UGT2B28Q9BY64 529 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 PELI2Q9HAT8 420 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 YAE1D1Q9NRH1 226 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 TAS2R13Q9NYV9 303 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 CNIH4Q9P003 139 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 IKZF3Q9UKT9 509 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC22A14Q9Y267 594 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 ANK2Q01484 3957 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 LRIT2A6NDA9 550 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 CD8B2A6NJW9 211 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 SDR42E2A6NKP2 422 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 BTNL10A8MVZ5 291 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 DEFB108AA8MXU0 73 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 H0Y3Z8 333 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 H3BML4 177 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 SAP18O00422 153 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 RTCAO00442 366 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 CTIFO43310 598 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 FGF17O60258 216 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 WDR47O94967 919 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 GOSR1O95249 250 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 IFNA2P01563 188 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 C1QAP02745 245 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 CYP4B1P13584 511 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 COX7A2P14406 83 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 PRKAR1BP31321 381 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLCO1A2P46721 670 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 RPL21P46778 160 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 ARFIP2P53365 341 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 NAGLUP54802 743 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 MTTPP55157 894 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 FBXW4P57775 412 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 GPS1Q13098 491 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 RAB32Q13637 225 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 VEZF1Q14119 521 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 RCAN2Q14206 197 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.67e-6■■■□□ 15.4
RPS6KC1-203ENST00000468069 MPEG1Q2M385 716 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 TRIM40Q6P9F5 258 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 PODNL1Q6PEZ8 512 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF550Q7Z398 422 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 PRR22Q8IZ63 422 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 SYCE1Q8N0S2 351 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF441Q8N8Z8 693 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS6KC1-203ENST00000468069 OR2L5Q8NG80 312 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms