RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 CSF1P09603 554 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 GATA3P23771 443 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 PNLIPRP2P54317 469 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 LMO4P61968 165 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 RAC1P63000 192 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM44Q2T9K0 475 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 OR52E8Q6IFG1 317 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 FCRLAQ7L513 359 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF100Q8IYN0 542 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 FBXO30Q8TB52 745 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 KCNS3Q9BQ31 491 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 EHD1Q9H4M9 534 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM185BQ9H7F4 350 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 PLLPQ9Y342 182 aa11.57□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1W2PR48 441 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 WNT9BO14905 357 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 SEC14L2O76054 403 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 HAUS5O94927 633 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 STIP1P31948 543 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 FEN1P39748 380 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 SLC1A2P43004 574 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 GDF5P43026 501 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 XKP51811 444 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 TCEAL1Q15170 157 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 ADIPOQQ15848 244 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 ADRM1Q16186 407 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 ARMCX4Q5H9R4 360 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 PAGE2BQ5JRK9 111 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 OR7E24Q6IFN5 339 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 VHLLQ6RSH7 139 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 CARM1Q86X55 608 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 UBE2J2Q8N2K1 259 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 DUSP19Q8WTR2 217 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 RGMAQ96B86 450 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 CENPKQ9BS16 269 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 DYNLRB1Q9NP97 96 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF69Q9UC07 566 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 NUP50Q9UKX7 468 aa11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1B0GTH6 734 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 CPMP14384 443 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 CLK3P49761 638 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 HNMTP50135 292 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 LAPTM5Q13571 262 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 KLHL22Q53GT1 634 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 AADACL2Q6P093 401 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 CYP20A1Q6UW02 462 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 SLC43A2Q8N370 569 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 OR4K14Q8NGD5 310 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 OR52R1Q8NGF1 315 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 CMTM7Q96FZ5 175 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 KLHL15Q96M94 604 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 MCMBPQ9BTE3 642 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 EFCAB11Q9BUY7 163 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 OR51B5Q9H339 312 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 KLHL9Q9P2J3 617 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 OPN4Q9UHM6 478 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa11.55□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 DNAH9Q9NYC9 4486 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 SH3PXD2BA1X283 911 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 FAM181BA6NEQ2 426 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 hCG_2039718K7EN88 272 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 PIP5K1CO60331 668 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 PPP1R3DO95685 299 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 OPN1MWP04001 364 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 OPN1MW2P0DN77 364 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 OPN1MW3P0DN78 364 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 PCNAP12004 261 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 PSPHP78330 225 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 CDYL2Q8N8U2 506 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 SLC30A2Q9BRI3 323 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 TSGA10Q9BZW7 698 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF665Q9H7R5 613 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 BCO1Q9HAY6 547 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 ANO10Q9NW15 660 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 PLEK2Q9NYT0 353 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 RNF114Q9Y508 228 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf3-211ENST00000463372 ASB4Q9Y574 426 aa11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms