RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449489.5

RBM39-218, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 5

Gene RBM39, Length 432 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-218ENST00000449489 ADAMDEC1O15204 470 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 TAPBPO15533 448 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 SEC14L5O43304 696 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 TBX1O43435 398 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 TSPAN2O60636 221 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 TTC4O95801 387 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 ATP1B1P05026 303 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 CPMP14384 443 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 EPORP19235 508 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 HK1P19367 917 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 AGTR1P30556 359 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 XKP51811 444 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 ARFIP2P53365 341 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 PNLIPRP2P54317 469 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 GYS2P54840 703 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 IRF9Q00978 393 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 IRF8Q02556 426 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 CHRNB3Q05901 458 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 CHIT1Q13231 466 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 CUL3Q13618 768 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 GGTLC2Q14390 218 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 SLMAPQ14BN4 828 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 TGFBIQ15582 683 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 PDK4Q16654 411 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 MED27Q6P2C8 311 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 GGNQ86UU5 652 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 CCDC25Q86WR0 208 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 CREG2Q8IUH2 290 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 OR2M3Q8NG83 312 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 TMBIM1Q969X1 311 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 ERP27Q96DN0 273 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 ADGRG7Q96K78 797 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 BTBD9Q96Q07 612 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 NAT9Q9BTE0 207 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 ITPAQ9BY32 194 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 GLOD5A6NK44 160 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 ABCD4O14678 606 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 PGRMC2O15173 223 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 TMPRSS11DO60235 418 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 REM1O75628 298 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 ZNF17P17021 662 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 PGAM1P18669 254 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 NT5EP21589 574 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 BSGP35613 385 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 EMDP50402 254 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 RAP1GDS1P52306 607 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 HILS1P60008 231 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 EGR3Q06889 387 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 CRYMQ14894 314 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 PPA1Q15181 289 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 NNATQ16517 81 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 MIDNQ504T8 468 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 AWAT1Q58HT5 328 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.45□□□□□ -1.38
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RBM39-218ENST00000449489 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 MAIP1Q8WWC4 291 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 MUCL1Q96DR8 90 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 JMJD8Q96S16 334 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 ADOQ96SZ5 270 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM39-218ENST00000449489 OR51B5Q9H339 312 aa6.45□□□□□ -1.38
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