RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 CD8BP10966 210 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 ACP2P11117 423 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 FCGR2AP12318 317 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 SDC1P18827 310 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT4P19013 534 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 CRYGSP22914 178 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 PRPH2P23942 346 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 MAP3K8P41279 467 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 GUSBP1Q15486 140 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 DUSP5Q16690 384 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 LIPMQ5VYY2 423 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 SHEQ5VZ18 495 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 Q6ZSR9 355 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 C22orf34Q6ZV56 151 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 ZAR1Q86SH2 424 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 C4orf33Q8N1A6 199 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 NUP43Q8NFH3 380 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 OR4C3Q8NH37 302 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 C16orf58Q96GQ5 468 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 CCT7Q99832 543 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 PRRG4Q9BZD6 226 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 SH3BP4Q9P0V3 963 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 PRR14LQ5THK1 2151 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 HIVEP2P31629 2446 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A087WZY1 265 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1W2PRB8 838 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNK2O95069 426 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 CHEK2O96017 543 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 PLGP00747 810 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 NGFRP08138 427 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 TBXA2RP21731 343 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 OCRLQ01968 901 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC18A2Q05940 514 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 ACKR1Q16570 336 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 GALNTL6Q49A17 601 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 MFSD12Q6NUT3 480 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 CLEC9AQ6UXN8 241 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 TDRPQ86YL5 185 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 DDIASQ8IXT1 998 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 COX18Q8N8Q8 333 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 CDRT4Q8N9R6 151 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC16A11Q8NCK7 471 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 OR10D3Q8NH80 312 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 JADE3Q92613 823 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 PIGTQ969N2 578 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 GIMAP5Q96F15 307 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 MARK4Q96L34 752 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 FCRL1Q96LA6 429 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 CCL19Q99731 98 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 NPAS1Q99742 590 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHDC3Q9BQ90 382 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 MED17Q9NVC6 651 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 NTMQ9P121 344 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 STOML1Q9UBI4 398 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 EMC9Q9Y3B6 208 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM233B4DJY2 109 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 CXCL13O43927 109 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 TBX19O60806 448 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM13O60858 407 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 SYNGR4O95473 234 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 THBDP07204 575 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 ALOX5P09917 674 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 NEFHP12036 1026 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 BCKDHAP12694 445 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 HPGDP15428 266 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF17P17021 662 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms