RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 G3V2L1 256 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 FFAR3O14843 346 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 GPR42O15529 346 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 B3GALT2O43825 422 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 CTNSO60931 367 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 NADKO95544 446 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 F10P00742 488 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 TPOP07202 933 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 GFAPP14136 432 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 M6PRP20645 277 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 CFL1P23528 166 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 PPP2R1BP30154 601 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 GPR143P51810 404 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 STX1BP61266 288 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF460Q14592 562 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 HSPB2Q16082 182 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 MPEG1Q2M385 716 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 ADPRMQ3LIE5 342 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 SLC36A3Q495N2 470 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 DEFB134Q4QY38 66 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 TBCELQ5QJ74 424 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 XAF1Q6GPH4 301 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 RHOUQ7L0Q8 258 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 STK32CQ86UX6 486 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 GPSM1Q86YR5 675 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 PLD3Q8IV08 490 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 PGAM4Q8N0Y7 254 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 PSD4Q8NDX1 1056 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 FAM222BQ8WU58 562 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 ASB15Q8WXK1 588 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 TSLPQ969D9 159 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 UBE2E3Q969T4 207 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 VPS33AQ96AX1 596 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 WDR34Q96EX3 536 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 MNTQ99583 582 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 ADI1Q9BV57 179 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 NARFLQ9H6Q4 476 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 ALG9Q9H6U8 611 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 PLSCR3Q9NRY6 295 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF358Q9NW07 568 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 LRBAP50851 2863 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 A0A1B0GTH9 108 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 KRT87PA6NCN2 255 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 PSMD9O00233 223 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 HDAC3O15379 428 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 DLX3O60479 287 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 CRCPO75575 148 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 ITGA10O75578 1167 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 KRT6AP02538 564 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 KRT6BP04259 564 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 F7P08709 466 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 IMPDH1P20839 514 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 ACVR2AP27037 513 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 PTGER1P34995 402 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 GMPRP36959 345 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 RPL14P50914 215 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 NME5P56597 212 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 PCDH1Q08174 1060 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 MERTKQ12866 999 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 PPP1R3AQ16821 1122 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM35AQ53FP2 167 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 CATSPEREQ5SY80 951 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 CYP20A1Q6UW02 462 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 EPGNQ6UW88 154 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 FKBP9P1Q75LS8 142 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 CADM2Q8N3J6 435 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 CBR4Q8N4T8 237 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 OR2M7Q8NG81 312 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 NUBPLQ8TB37 319 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 RAB2BQ8WUD1 216 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 GPR78Q96P69 363 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 HES7Q9BYE0 225 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 RHBGQ9H310 441 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 GIMAP4Q9NUV9 329 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 CNIH4Q9P003 139 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 OARD1Q9Y530 152 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRR-204ENST00000440835 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
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