RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 MIOXQ9UGB7 285 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2W5A6NFC9 320 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 GJB5O95377 273 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RD3LP0DJH9 198 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 GABRA1P14867 456 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 GJA1P17302 382 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MC4RP32245 332 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RFC3P40938 356 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 XCR1P46094 333 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 EPHA4P54764 986 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 UPP1Q16831 310 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 GCNT6Q5T4J0 391 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TMUB2Q71RG4 321 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 NFKBIDQ8NI38 313 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 LRR1Q96L50 414 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CHST8Q9H2A9 424 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 EQTNQ9NQ60 294 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 DSPPQ9NZW4 1301 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CENPFP49454 3210 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 DISC1C4P0D8 188 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10H3O60404 316 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 POP7O75817 140 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 HTR3BO95264 441 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF12O95522 483 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 IGF2P01344 180 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 EBLN1P0CF75 366 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR12D1P0DN82 309 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 LIMS1P48059 325 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 FNTBP49356 437 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 VEGFCP49767 419 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SSTP61278 116 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 DGCR2P98153 550 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXK2Q01167 660 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MTAPQ13126 283 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SYT14P1Q58G82 188 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 COX20Q5RI15 118 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RNLSQ5VYX0 342 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF852Q6ZMS4 543 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF783Q6ZMS7 281 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR56B4Q8NH76 319 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-CQ95604 372 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 C14orf105Q9NVL8 296 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 LHX6Q9UPM6 363 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CKAP5Q14008 2032 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 FZD7O75084 574 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SOX30O94993 753 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN9O95484 217 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 HPP00738 406 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 WNT1P04628 370 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF224P0DH78 156 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM6P0DI80 62 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CBSLP0DN79 551 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 UGT2B7P16662 529 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PRPS1L1P21108 318 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CBSP35520 551 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPZA1P52907 286 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF7Q14155 803 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC5A12Q1EHB4 618 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ALG11Q2TAA5 492 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 XKR6Q5GH73 641 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 HES5Q5TA89 166 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf73Q69YU5 71 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 NOXRED1Q6NXP6 359 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC24A5Q71RS6 500 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OAFQ86UD1 273 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OXR1Q8N573 874 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms