RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DSN1Q9H410 356 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SAR1AQ9NR31 198 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MKLN1Q9UL63 735 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ABCG2Q9UNQ0 655 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A096LPI6 279 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A1L4Q6 167 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 H0YC42 278 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FXYD1O00168 92 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LRRTM2O43300 516 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZG16O60844 167 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRAPPC6AO75865 159 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SNX4O95219 450 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 H6PDO95479 791 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STSP08842 583 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ABOP16442 354 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IL11P20809 199 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CA7P43166 264 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MTPNP58546 118 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPP38P78345 283 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KCNC4Q03721 635 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF117Q03924 483 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CHRNEQ04844 493 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KLF10Q13118 480 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPR68Q15743 365 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LRIF1Q5T3J3 769 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 REP15Q6BDI9 236 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CBLN3Q6UW01 205 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DHDDSQ86SQ9 333 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PACS2Q86VP3 889 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SNX32Q86XE0 403 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLCZ1Q86YW0 608 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TREML1Q86YW5 311 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAL2Q969L2 176 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ROPN1LQ96C74 230 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZG16BQ96DA0 208 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC120Q96HB5 630 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ITCHQ96J02 903 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SIKE1Q9BRV8 207 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UGT2B28Q9BY64 529 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EXO5Q9H790 373 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DKKL1Q9UK85 242 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCDHGB4Q9UN71 923 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 USP22Q9UPT9 525 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VDAC3Q9Y277 283 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 L3MBTL1Q9Y468 752 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A1B0GVC2 190 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TTC36A6NLP5 189 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ALG1L2C9J202 215 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AQP7O14520 342 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADAM11O75078 769 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UGT2B17O75795 530 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AGFG2O95081 481 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANP32DO95626 131 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LDLRP01130 860 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HPNP05981 417 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BCHEP06276 602 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRT16P08779 473 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATP6V1C1P21283 382 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TBXA2RP21731 343 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTGS2P35354 604 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STARP49675 285 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DSTNP60981 165 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FOXF1Q12946 379 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SNTA1Q13424 505 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPAT3Q53EU6 434 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C4orf17Q53FE4 359 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RTL6Q6ICC9 239 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms