RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410629.1

RNU6-1025P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1025, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1025P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 OR5M11Q96RB7 305 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CCT8L2Q96SF2 557 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 DPH7Q9BTV6 452 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 GLT8D2Q9H1C3 349 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ANAPC7Q9UJX3 599 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SMC3Q9UQE7 1217 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 L3MBTL1Q9Y468 752 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 A0A1W2PNV4 684 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 A0A1W2PQ72 361 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SAGE2PA6NJ88 616 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 OR6C65A6NJZ3 312 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 STX7O15400 261 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 TSC22D2O75157 780 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 THY1P04216 161 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 IGF1P05019 195 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 NT5EP21589 574 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 TBXA2RP21731 343 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CALRP27797 417 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PSMA5P28066 241 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 OTX2P32243 289 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 NF2P35240 595 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 MAGEA5P43359 124 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 TAF6P49848 677 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ERVPABLB-1P60509 514 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 RPL8P62917 257 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CXCL6P80162 114 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 RGS1Q08116 209 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CD47Q08722 323 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ZNF154Q13106 437 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ASAH1Q13510 395 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SERTAD2Q14140 314 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 DPYSL3Q14195 570 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 KCNJ11Q14654 390 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 TGIF1Q15583 401 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CHI3L2Q15782 390 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 MAPK6Q16659 721 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 QRICH1Q2TAL8 776 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 USH1GQ495M9 461 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 RABGAP1LQ5R372 815 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 UTF1Q5T230 341 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 MARC1Q5VT66 337 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 METTL11BQ5VVY1 283 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SLC22A10Q63ZE4 541 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SPINK14Q6IE38 97 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 GALNT17Q6IS24 598 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CGB2Q6NT52 195 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 VITQ6UXI7 678 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 Q6ZR54 194 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SERPINA9Q86WD7 417 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 HPS6Q86YV9 775 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 GPD1LQ8N335 351 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CSNK1A1LQ8N752 337 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ZNF540Q8NDQ6 660 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 OR9A4Q8NGU2 314 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CCDC26Q8TAB7 109 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 RAET1EQ8TD07 263 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 GTSF1Q8WW33 167 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 VPS39Q96JC1 886 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PAXXQ9BUH6 204 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 DUSP16Q9BY84 665 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 RAB33BQ9H082 229 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 OR10H1Q9Y4A9 318 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ATP10DQ9P241 1426 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 E9PLD3 99 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ZSCAN12O43309 604 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 B3GAT3O94766 335 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 NOL4O94818 638 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SLC35E2P0CK97 266 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 TPSB2P20231 275 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 FASP25445 335 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 GDF1P27539 372 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 MDH2P40926 338 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 BDKRB1P46663 353 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 RPL32P62910 135 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 VLDLRP98155 873 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CNTN2Q02246 1040 aa2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms