RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409148.1

LRRTM1-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,126 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-202ENST00000409148 FMO6PO60774 539 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 NSA2O95478 260 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 RAB36O95755 333 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TGM1P22735 817 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 FAM53BQ14153 422 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 NDUFA5Q16718 116 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 OR6C4Q8NGE1 309 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 FGF11Q92914 225 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SHDQ96IW2 340 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 OR51E2Q9H255 320 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 FBXO34Q9NWN3 711 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 KLHL3Q9UH77 587 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 FBXL21Q9UKT6 434 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PLCL2Q9UPR0 1127 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 GXYLT2A0PJZ3 443 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CDHR4A6H8M9 788 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PEX12O00623 359 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CLDN4O14493 209 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MYL12BO14950 172 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PRODHO43272 600 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 KLF4O43474 513 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 FOXS1O43638 330 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CTNSO60931 367 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SCG5P05408 212 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 GRK5P34947 590 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 GPR4P46093 362 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SPHARQ15513 63 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 GARNL3Q5VVW2 1013 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 C19orf48Q6RUI8 117 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 AMER2Q8N7J2 671 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MCFD2Q8NI22 146 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PEX11GQ96HA9 241 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 FOXQ1Q9C009 403 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 IL20Q9NYY1 176 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 KCNE5Q9UJ90 142 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 NPIPA7E9PJI5 369 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CSO75390 466 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 NTN1O95631 604 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 NPIPA8P0DM63 369 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 STARD6P59095 220 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TMEM44Q2T9K0 475 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 C6orf183Q5T699 404 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CLDN22Q8N7P3 220 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 NANOGP1Q8N7R0 232 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 RIT1Q92963 219 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF285Q96NJ3 590 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 OPALINQ96PE5 141 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 NELL2Q99435 816 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TAPBPLQ9BX59 468 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MMP27Q9H306 513 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 C14orf105Q9NVL8 296 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SOHLH2Q9NX45 425 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 NOX1Q9Y5S8 564 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TLCD2A6NGC4 264 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 LMO7DNF2Z398 122 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ARHGAP33O14559 1287 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PIP5K1CO60331 668 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 KCNK2O95069 426 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MED26O95402 600 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 GUSBP08236 651 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 GNSP15586 552 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 NXPH1P58417 271 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 IFITM3Q01628 133 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SELENBP1Q13228 472 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 OR1Q1Q15612 314 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF404Q494X3 552 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TCTE1Q5JU00 501 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PERM1Q5SV97 790 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF620Q6ZNG0 422 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 POGLUT1Q8NBL1 392 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 FOLH1BQ9HBA9 442 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CAPN10Q9HC96 672 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MED17Q9NVC6 651 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CDH10Q9Y6N8 788 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms