RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 RAP2CQ9Y3L5 183 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ZNF175Q9Y473 711 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 CSPG4Q6UVK1 2322 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 TMEM120BA0PK00 339 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 TRIM64A6NGJ6 449 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 TRIM64BA6NI03 449 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 LINC01387J3KSC0 135 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 SEC14L5O43304 696 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 EMC8O43402 210 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 SCO2O43819 266 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 SNNO75324 88 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 TNFRSF21O75509 655 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 JUNP05412 331 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 BCKDHAP12694 445 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 HK1P19367 917 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 CCKARP32238 428 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 EVI2BP34910 448 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 MPIP34949 423 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 C21orf58P58505 322 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 B3GALT5-AS1P59052 145 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 RPL38P63173 70 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 C6orf136Q5SQH8 315 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 LRRC34Q8IZ02 419 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 FAM9CQ8IZT9 166 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ZNF781Q8N8C0 355 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 RNF138Q8WVD3 245 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 MTERF3Q96E29 417 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PPP3R2Q96LZ3 170 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PINK1Q9BXM7 581 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 GSX2Q9BZM3 304 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 CENPHQ9H3R5 247 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PTGES2Q9H7Z7 377 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ANKRA2Q9H9E1 313 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 RNF122Q9H9V4 155 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 FOLH1BQ9HBA9 442 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 SDHAF3Q9NRP4 125 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ASIC5Q9NY37 505 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 TAS2R9Q9NYW1 312 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 NTMQ9P121 344 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 FIS1Q9Y3D6 152 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ZANQ9Y493 2812 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 COQ9O75208 318 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 HSPA4LO95757 839 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 CD8BP10966 210 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 BGNP21810 368 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ASMTP46597 345 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 CLK3P49761 638 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 GAS1P54826 345 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 BST1Q10588 318 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 STX5Q13190 355 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PON3Q15166 354 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ZNF385BQ569K4 471 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 AGBL2Q5U5Z8 902 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 NPSR1Q6W5P4 371 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ZNF550Q7Z398 422 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 RIMKLAQ8IXN7 391 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 DDIASQ8IXT1 998 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 KIRREL3Q8IZU9 778 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 OR2L13Q8N349 312 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 FADS6Q8N9I5 356 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 OR2M3Q8NG83 312 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 OR7G2Q8NG99 324 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 FIG4Q92562 907 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 AMDHD1Q96NU7 426 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PIGQQ9BRB3 760 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 KLHL4Q9C0H6 718 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 DSN1Q9H410 356 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 GLIPR2Q9H4G4 154 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 REEP4Q9H6H4 257 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 MIEF1Q9NQG6 463 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PROCRQ9UNN8 238 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ABCG2Q9UNQ0 655 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 WDR91A4D1P6 747 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 INAFM1C9JVW0 142 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 H3BML4 177 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 NME6O75414 186 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PPP3CBP16298 524 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 MAP3K8P41279 467 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 SLC1A6P48664 564 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PTH2RP49190 550 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 MLC1Q15049 377 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 CYP27C1Q4G0S4 372 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 AGR3Q8TD06 166 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms