RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 FRMPD2BQ6IN97 320 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MACROD1Q9BQ69 325 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM246Q9BRR3 403 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 FAM227AF5H4B4 570 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD28O15084 1053 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PRSS3P35030 304 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 GJA4P35212 333 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEA3P43357 314 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CXCR4P61073 352 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 BPIFA2Q96DR5 249 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SFXN2Q96NB2 322 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MRI1Q9BV20 369 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MYO10Q9HD67 2058 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 H3BML4 177 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 LDB3O75112 727 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 GPR75O95800 540 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SLC26A5P58743 744 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 NFATC4Q14934 902 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 MFSD6LQ8IWD5 586 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 OR2A12Q8NGT7 310 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R3Q9NYW6 316 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 IFNA5P01569 189 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 C1SP09871 688 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 FOSL2P15408 326 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SOX3P41225 446 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CXCL12P48061 93 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 DAP3P51398 398 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 MLC1Q15049 377 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF417Q8TAU3 575 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 THSD1Q9NS62 852 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 AMY2AP04746 511 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SFTPDP35247 375 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CDS1Q92903 461 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CPNE5Q9HCH3 593 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 E2F3O00716 465 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 RHEBQ15382 184 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SLC5A12Q1EHB4 618 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SPTSSAQ969W0 71 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 HHIPQ96QV1 700 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 NAV1Q8NEY1 1877 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 MMP2P08253 660 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SLC15A4Q8N697 577 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SYT3Q9BQG1 590 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ADAM29Q9UKF5 820 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 PXNP49023 591 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 TP53I3Q53FA7 332 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 AWAT2Q6E213 333 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CD300LFQ8TDQ1 290 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 OR2B2Q9GZK3 357 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SAP130Q9H0E3 1048 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 FAM171A2A8MVW0 826 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 RGS19P49795 217 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 GGTA1PQ4G0N0 100 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC58Q4VC31 144 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 HES5Q5TA89 166 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 LIX1LQ8IVB5 337 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 LMF1Q96S06 567 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 POT1Q9NUX5 634 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 MYH15Q9Y2K3 1946 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 PRR22Q8IZ63 422 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SPARTQ8N0X7 666 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 B3GNT7Q8NFL0 401 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 OR52R1Q8NGF1 315 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 OR5W2Q8NH69 310 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ASB12Q8WXK4 309 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 TMIGD2Q96BF3 282 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SACM1LQ9NTJ5 587 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 H0YIV9 168 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 IFNA2P01563 188 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CD38P28907 300 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 PTH2RP49190 550 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 METTL4Q8N3J2 472 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 TM9SF4Q92544 642 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 NT5C3BQ969T7 300 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ASB4Q9Y574 426 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 H3BMQ9 156 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 FOLR3P41439 243 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 HBA1P69905 142 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 FAM26DQ5JW98 314 aa19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 222.1 ms