RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 GPR83Q9NYM4 423 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 IL36AQ9UHA7 158 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PQH9 124 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 C9J4A7 227 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ENDOD1O94919 500 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 AIFM1O95831 613 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SMIM6P0DI80 62 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ACRV1P26436 265 aa4.65□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF92Q03936 586 aa4.65□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 AKIRIN2Q53H80 203 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 OPN5Q6U736 354 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 GDPD4Q6W3E5 623 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CHST4Q8NCG5 386 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 SAP130Q9H0E3 1048 aa4.65□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF337Q9Y3M9 751 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF254O75437 659 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 BEST1O76090 585 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FGF18O76093 207 aa4.65□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 CX3CR1P49238 355 aa4.65□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 POM121Q96HA1 1249 aa4.65□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 PIGQQ9BRB3 760 aa4.65□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 SIP14410 1827 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GUH1 482 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 SDHDO14521 159 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC3AO75596 197 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 OR4M1Q8NGD0 313 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHA2Q9HB19 425 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 A4GALTQ9NPC4 353 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TVP23BQ9NYZ1 205 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 NEK7Q8TDX7 302 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 KCNIP1Q9NZI2 227 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa4.65□□□□□ -1.67
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