RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 SLC37A3Q8NCC5 494 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SCGB1C1Q8TD33 95 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 OR4K3Q96R72 315 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SLC6A7Q99884 636 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TLCD2A6NGC4 264 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CAPN3P20807 821 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 AKR1D1P51857 326 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SLC26A5P58743 744 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MAB21L1Q13394 359 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 KNL1Q8NG31 2342 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MAS1P04201 325 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 PCBD1P61457 104 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 XKRXQ6PP77 449 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 UGT2A3Q6UWM9 527 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 GPR39O43194 453 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SNAPC5O75971 98 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 LPLP06858 475 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 OR5D16Q8NGK9 328 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 NELFAQ9H3P2 528 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 IL20RAQ9UHF4 553 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MMP17Q9ULZ9 603 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MYH1P12882 1939 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 GABRR3A8MPY1 467 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 IFNA7P01567 189 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 CNR2P34972 360 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 PSPHP78330 225 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 SYT14Q8NB59 555 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 NETO1Q8TDF5 533 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 SLC6A18Q96N87 628 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 SMIM14Q96QK8 99 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 CDC14CA4D256 554 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 TNFRSF10CO14798 259 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 PTHP01270 115 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 SOX3P41225 446 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 SSR4P51571 173 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 PIGGQ5H8A4 983 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 HINT2Q9BX68 163 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 NPIPA7E9PJI5 369 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 NPIPA8P0DM63 369 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 CHRNB4P30926 498 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 TPMTP51580 245 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 INHBCP55103 352 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 CHRNEQ04844 493 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 MICAQ29983 383 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 TBX21Q9UL17 535 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 SFTPBP07988 381 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 ART1P52961 327 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF45Q02386 682 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 ERV3-1Q14264 604 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 AWAT2Q6E213 333 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 SERPINA11Q86U17 422 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 OR10A5Q9H207 317 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 OR10A2Q9H208 303 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 NUP50Q9UKX7 468 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 NME4O00746 187 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 HTR3BO95264 441 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRO-202ENST00000348962 FOXA1P55317 472 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms