RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM157BP0CG42 384 aa20.03■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 MTNR1BP49286 362 aa20.03■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 CLDN20P56880 219 aa20.03■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 RGS1Q08116 209 aa20.03■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa20.03■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 PLBD1Q6P4A8 553 aa20.03■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF836Q6ZNA1 936 aa20.03■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 LIX1LQ8IVB5 337 aa20.03■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 YIPF7Q8N8F6 280 aa20.03■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 NACC2Q96BF6 587 aa20.03■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 C10orf90Q96M02 699 aa20.03■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 PHF11Q9UIL8 331 aa20.03■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 UNC119BA6NIH7 251 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 C12orf71A8MTZ7 269 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 ORC5O43913 435 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 GJA4P35212 333 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 SPRED2Q7Z698 418 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 GLCCI1Q86VQ1 547 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 OR52L1Q8NGH7 329 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 MARVELD1Q9BSK0 173 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 OR52D1Q9H346 318 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 FN3KQ9H479 309 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 RFXAPO00287 272 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 CTBP2P56545 445 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 DUSP8Q13202 625 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 FZD5Q13467 585 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 RUNX3Q13761 415 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 IDNKQ5T6J7 187 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 OR4K14Q8NGD5 310 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM63Q969Q1 353 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 CD180Q99467 661 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 ALG8Q9BVK2 526 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 ING3Q9NXR8 418 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 OR6C2Q9NZP2 312 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 MAU2Q9Y6X3 613 aa20.02■□□□□ 0.8
PTDSS1-201ENST00000337004 LINC01553A4QN01 128 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC43A1O75387 559 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 BMP7P18075 431 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 FAPQ12884 760 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 SMARCD3Q6STE5 483 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 AMIGO1Q86WK6 493 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 OR2L13Q8N349 312 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 GON7Q9BXV9 100 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 EXTL2Q9UBQ6 330 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 TRAPPC13A5PLN9 417 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 THBS1P07996 1170 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 ZGLP1P0C6A0 271 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 TNFRSF17Q02223 184 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 NIPAL3Q6P499 406 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 B3GLCTQ6Y288 498 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 VN1R4Q7Z5H5 301 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 ASPGQ86U10 573 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 PAQR7Q86WK9 346 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 LCN9Q8WX39 176 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 ART5Q96L15 291 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM36Q9NQ86 728 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 OBP2AQ9NY56 170 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa20.01■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 ELK1P19419 428 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 PTNP21246 168 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 F8A1P23610 371 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 TALDO1P37837 337 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF136P52737 540 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 GPR68Q15743 365 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 TRILQ7L0X0 811 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 FANK1Q8TC84 345 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 ZFAND1Q8TCF1 268 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 UPRTQ96BW1 309 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 HS6ST2Q96MM7 605 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 SDF2Q99470 211 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 DPH1Q9BZG8 443 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 DAPL1A0PJW8 107 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 SCAMP1O15126 338 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 DUSP5Q16690 384 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 Q5BKY6 102 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 HBMQ6B0K9 141 aa20■□□□□ 0.79
PTDSS1-201ENST00000337004 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms