RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 CCSMST1Q4G0I0 132 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 OR4N5Q8IXE1 308 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 MS4A15Q8N5U1 240 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 NKD1Q969G9 470 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 MYADMQ96S97 322 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SLC43A1O75387 559 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 GAB1Q13480 694 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM69Q5SWH9 247 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 FAHD1Q6P587 224 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 MSRB3Q8IXL7 192 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ALG8Q9BVK2 526 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SLC22A31A6NKX4 558 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 AGR2O95994 175 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TFP02787 698 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ACP2P11117 423 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 PTGER1P34995 402 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TGM4P49221 684 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 PRLHRP49683 370 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 Q6ZSR6 202 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ABHD13Q7L211 337 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 VN1R2Q8NFZ6 395 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 GABRPO00591 440 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 C1QBP02746 253 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 PKLRP30613 574 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 DEFB110Q30KQ9 67 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SAMD8Q96LT4 415 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TM7SF3Q9NS93 570 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 OR6C2Q9NZP2 312 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ALDOBP05062 364 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 PRKCAP17252 672 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 GABRA5P31644 462 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 PDZD9Q8IXQ8 264 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 HORMAD2Q8N7B1 307 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF563Q8TA94 476 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ZFAND1Q8TCF1 268 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TRPV4Q9HBA0 871 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 C14orf105Q9NVL8 296 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 FAM183AA6NL82 134 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 MAN2B1O00754 1011 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ARPC5O15511 151 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 CD2P06729 351 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TACSTD2P09758 323 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 GRK6P43250 576 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 GZMKP49863 264 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 BTN1A1Q13410 526 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ELOA3BQ3SY89 546 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 RAB12Q6IQ22 244 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM107Q6UX40 140 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SLC9B2Q86UD5 537 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC190Q86UF4 302 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SPERTQ8NA61 448 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ELOA3Q8NG57 546 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 RIT1Q92963 219 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SIRT5Q9NXA8 310 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SOX30O94993 753 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ODF4Q2M2E3 257 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 PAQR6Q6TCH4 344 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF740Q8NDX6 193 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 NUP43Q8NFH3 380 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SLC25A46Q96AG3 418 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 MYNNQ9NPC7 610 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 LIPT1Q9Y234 373 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 NPC1O15118 1278 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 RBBP9O75884 186 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 CTHP32929 405 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SYPL1Q16563 259 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ACER3Q9NUN7 267 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF226Q9NYT6 803 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1B0GVT2 93 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 XKRYO14609 159 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SLC25A12O75746 678 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 KRT33AO76009 404 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SLC14A1Q13336 389 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 DUSP7Q16829 419 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms