RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258098.6

RAB11FIP5-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP5, Length 4,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5-201ENST00000258098 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SCN5AQ14524 2016 aa18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RAD1O60671 282 aa18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 UBXN7O94888 489 aa18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DBIP07108 87 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CXCR1P25024 350 aa18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SLC6A6P31641 620 aa18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RCVRNP35243 200 aa18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GBX1Q14549 363 aa18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 YIPF7Q8N8F6 280 aa18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 AVL9Q8NBF6 648 aa18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FRMD6Q96NE9 622 aa18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ALG8Q9BVK2 526 aa18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TCF7L1Q9HCS4 588 aa18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 A4GALTQ9NPC4 353 aa18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 OMPP47874 163 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DUSP5Q16690 384 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DECR1Q16698 335 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MPEG1Q2M385 716 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TMEM44Q2T9K0 475 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GFOD2Q3B7J2 385 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ARTNQ5T4W7 220 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ARHGAP40Q5TG30 622 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BPIFA2Q96DR5 249 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CHD5Q8TDI0 1954 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 IGHA2P01877 340 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PSMB10P40306 273 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CD300CQ08708 224 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TAF13Q15543 124 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EGFL6Q8IUX8 553 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PTPN6P29350 595 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRIM23P36406 574 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 OR7G2Q8NG99 324 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NEK6Q9HC98 313 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 COPS7AQ9UBW8 275 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ERVK-11Q9UQG0 969 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FAM172BPA6NC97 362 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HPGDSO60760 199 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GPX5O75715 221 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MFSD9Q8NBP5 474 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GPR32P1Q8NGA4 272 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 C1orf216Q8TAB5 229 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SLC6A20Q9NP91 592 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CENPMQ9NSP4 180 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CASC3O15234 703 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EMP3P54852 163 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 OR1Q1Q15612 314 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CNIH2Q6PI25 160 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CDRT4Q8N9R6 151 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 OR6N2Q8NGY6 317 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SMPDL3BQ92485 455 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MSLNLQ96KJ4 702 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DOCK4Q8N1I0 1966 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ORC5O43913 435 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KIR2DS3Q14952 304 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DUSP6Q16828 381 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HS6ST2Q96MM7 605 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MAN2B1O00754 1011 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PAPLNO95428 1278 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 OR1D4P47884 311 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SLC35A4Q96G79 324 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GPATCH2Q9NW75 528 aa18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 METTL15A6NJ78 407 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LRRTM2O43300 516 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ETV5P41161 510 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ETV1P50549 477 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 OR52I1Q8NGK6 324 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TMEM163Q8TC26 289 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TBC1D20Q96BZ9 403 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ANXA2P2A6NMY6 339 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TPMTP51580 245 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SYT14P1Q58G82 188 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CADM3Q8N126 398 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LNX2Q8N448 690 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MOSPD2Q8NHP6 518 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RSC1A1Q92681 617 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms