RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.23■■□□□ 1.79
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NBPF14Q5TI25 921 aa26.23■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NBPF15Q8N660 670 aa26.23■■□□□ 1.79
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AK2P54819 239 aa26.23■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BRD1O95696 1058 aa26.22■■□□□ 1.79
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.21■■□□□ 1.79
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FSD1Q9BTV5 496 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.21■■□□□ 1.79
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.21■■□□□ 1.79
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TFCP2Q12800 502 aa26.2■■□□□ 1.78
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RUFY3Q7L099 469 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DTNBO60941 627 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GPT2Q8TD30 523 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COPRSQ9NQ92 184 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IL2RBP14784 551 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCNJ4P48050 445 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A0D9SFI3 127 aa26.18■■□□□ 1.78
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EVA1CP58658 441 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CASP7P55210 303 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNNI3KQ59H18 835 aa26.16■■□□□ 1.78
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERBB4Q15303 1308 aa26.16■■□□□ 1.78
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa26.15■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NECTIN1Q15223 517 aa26.14■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.14■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GLI3P10071 1580 aa26.14■■□□□ 1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HIP1O00291 1037 aa26.14■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.14■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GDPD2Q9HCC8 539 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHGBP05060 677 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAP4K1Q92918 833 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FOXO4P98177 505 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.1■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.1■■□□□ 1.77
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.1■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC27A2O14975 620 aa26.09■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.09■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RRP9O43818 475 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP5JP18859 108 aa26.09■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCNB2Q92953 911 aa26.09■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM63CQ9P1W3 806 aa26.09■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF445P59923 1031 aa26.08■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VPS53Q5VIR6 699 aa26.08■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.08■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.08■■□□□ 1.77
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NASPP49321 788 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.07■■□□□ 1.76
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.07■■□□□ 1.76
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