RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 FOXO4P98177 505 aa27.37■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.36■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 LMBR1LQ6UX01 489 aa27.36■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 AACSQ86V21 672 aa27.36■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 CHMLP26374 656 aa27.35■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.35■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.35■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 HSCBQ8IWL3 235 aa27.35■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.35■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 USP21Q9UK80 565 aa27.35■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 SIL1Q9H173 461 aa27.34■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.33■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 SIK1P57059 783 aa27.33■■□□□ 1.97
USP36-218ENST00000590546 ATP6V1AP38606 617 aa27.32■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 KIF2CQ99661 725 aa27.32■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.32■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 A0A0G2JS52 829 aa27.32■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 ARXQ96QS3 562 aa27.32■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.31■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 PALLDQ8WX93 1383 aa27.31■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 RABEP1Q15276 862 aa27.3■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.3■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 CHMP3Q9Y3E7 222 aa27.3■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.3■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 AK9Q5TCS8 1911 aa27.29■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 FBXO3Q9UK99 471 aa27.29■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 MCCP23508 829 aa27.27■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 EVI5LQ96CN4 794 aa27.27■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.27■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 NLRP10Q86W26 655 aa27.27■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 GPR108Q9NPR9 543 aa27.27■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa27.26■■□□□ 1.96
USP36-218ENST00000590546 CIAO1O76071 339 aa27.26■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 HLFQ16534 295 aa27.26■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 TNNI3KQ59H18 835 aa27.26■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.26■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 RREB1Q92766 1687 aa27.26■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 TFCP2Q12800 502 aa27.25■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 RUFY2Q8WXA3 655 aa27.25■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 HIP1O00291 1037 aa27.24■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 MYT1Q01538 1121 aa27.24■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.24■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 IL27Q8NEV9 243 aa27.24■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.23■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 EYA2O00167 538 aa27.23■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 CSF1RP07333 972 aa27.23■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 FAM89AQ96GI7 184 aa27.22■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 NUP98P52948 1817 aa27.22■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 KCNQ2O43526 872 aa27.22■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 ANAPC15P60006 121 aa27.22■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 ITPK1Q13572 414 aa27.22■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.22■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 HSPA1LP34931 641 aa27.21■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.21■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.21■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa27.21■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 SGSM2O43147 1006 aa27.2■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 ATP5JP18859 108 aa27.2■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 GPTP24298 496 aa27.2■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 ATG9AQ7Z3C6 839 aa27.2■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 AK7Q96M32 723 aa27.2■■□□□ 1.95
USP36-218ENST00000590546 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 ANTXR1Q9H6X2 564 aa27.18■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 PARP10Q53GL7 1025 aa27.17■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 IL17RAQ96F46 866 aa27.17■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 ST18O60284 1047 aa27.17■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa27.17■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 RGL2O15211 777 aa27.16■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 AFF2P51816 1311 aa27.16■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 PDE8AO60658 829 aa27.15■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.15■■□□□ 1.94
USP36-218ENST00000590546 TICAM2Q86XR7 235 aa27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms