RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 C6orf229H3BNL8 230 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 MMP16P51512 607 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 KRT28Q7Z3Y7 464 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 C1orf216Q8TAB5 229 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM200AQ8TCP9 573 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 NPHP3Q7Z494 1330 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L15C9J2P7 530 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L10C9JJH3 530 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L12C9JPN9 530 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L11C9JVI0 530 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L21D6R901 530 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L18D6R9N7 530 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L22D6RA61 530 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L19D6RCP7 530 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L20D6RJB6 530 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L24Q0WX57 530 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 SWI5Q1ZZU3 235 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 NBPF8Q3BBV2 869 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 DESI1Q6ICB0 168 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 NPAS4Q8IUM7 802 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 CDK19Q9BWU1 502 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD33BA6NCL7 494 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L5A8MUK1 530 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 SKIP12755 728 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 ILDR2Q71H61 639 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP4X1Q8N118 509 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF592Q92610 1267 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 DLC1Q96QB1 1528 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 ZBBXA8MT70 800 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 DXOO77932 396 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 PTK7Q13308 1070 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 BCL11AQ9H165 835 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 LAMC1P11047 1609 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 TONSLQ96HA7 1378 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 PHLPP1O60346 1717 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 ADGRB1O14514 1584 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 AVPP01185 164 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP2B4P23634 1241 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM32Q13049 653 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 Q3C1V9 767 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 EGFL7Q9UHF1 273 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 PIK3CDO00329 1044 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 CARD11Q9BXL7 1154 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-216ENST00000590105 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 NALCNQ8IZF0 1738 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXO45P0C2W1 286 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 SMPD1P17405 629 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 RASA1P20936 1047 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 SERPINB4P48594 390 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 COL19A1Q14993 1142 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 CRIPAKQ8N1N5 446 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 MRGPRX2Q96LB1 330 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 KNDC1Q76NI1 1749 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 J3QL48 77 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 WNT7AO00755 349 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 SKOR1P84550 965 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 POTEAQ6S8J7 498 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF135Q8IUD6 432 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKMY2Q8IV38 441 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 UBXN4Q92575 508 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 NGLY1Q96IV0 654 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 PRR36Q9H6K5 1346 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC24Q8N4L8 307 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 GPRASP1Q5JY77 1395 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 PNPLA6Q8IY17 1366 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAMTS2O95450 1211 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-216ENST00000590105 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms