RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583763.1

CSAG4-202, Transcript of CSAG family member 4 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene CSAG4, Length 237 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG4-202ENST00000583763 C1orf141Q5JVX7 400 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG4-202ENST00000583763 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CSAG4-202ENST00000583763 CCDC102AQ96A19 550 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG4-202ENST00000583763 OTUD5Q96G74 571 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG4-202ENST00000583763 USP48Q86UV5 1035 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 TRPM4Q8TD43 1214 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 CEP290O15078 2479 aa13.44□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 SHTN1A0MZ66 631 aa13.44□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 SLC10A3P09131 477 aa13.44□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 CXCL9Q07325 125 aa13.44□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 LARGE2Q8N3Y3 721 aa13.43□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa13.43□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa13.43□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 RNMTO43148 476 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 STARD3NLO95772 234 aa13.42□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 ALDH1B1P30837 517 aa13.42□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 NEUROD1Q13562 356 aa13.42□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 UNC80Q8N2C7 3258 aa13.42□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 TBC1D8O95759 1140 aa13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 A1BGP04217 495 aa13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 CRY2Q49AN0 593 aa13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 LAMA3Q16787 3333 aa13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 NPHP1O15259 732 aa13.4□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 HDAC9Q9UKV0 1011 aa13.4□□□□□ -0.26
CSAG4-202ENST00000583763 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa13.39□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 GPR25O00155 361 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 EGFRP00533 1210 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 EN2P19622 333 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 RASAL3Q86YV0 1011 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 NIM1KQ8IY84 436 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 HEG1Q9ULI3 1381 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 AOC3Q16853 763 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 SULT6B1Q6IMI4 303 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 CLEC4GQ6UXB4 293 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 TPTE2Q6XPS3 522 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 C2orf69Q8N8R5 385 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 ZNRF3Q9ULT6 936 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 CDHR2Q9BYE9 1310 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 VCANP13611 3396 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 ADM5C9JUS6 153 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 H0YGN5 161 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 SLC24A1O60721 1099 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 PPIP5K2O43314 1243 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 SAMD7Q7Z3H4 446 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 ABCC12Q96J65 1359 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 GRIPAP1Q4V328 841 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 KRT26Q7Z3Y9 468 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CSAG4-202ENST00000583763 FAM177BA6PVY3 158 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 YDJCA8MPS7 323 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 RAD17O75943 681 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 TM4SF4P48230 202 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 VPS33BQ9H267 617 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 PRO3102Q9H379 93 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 RIC1Q4ADV7 1423 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 IL13P35225 146 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF790Q6PG37 636 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 MICALL2Q8IY33 904 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 CFHR5Q9BXR6 569 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 KIF7Q2M1P5 1343 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 HLFQ16534 295 aa13.31□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.31□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 USP16Q9Y5T5 823 aa13.31□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 FKTNO75072 461 aa13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 NUTM1Q86Y26 1132 aa13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 CRAMP1Q96RY5 1269 aa13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 BCL2L13Q9BXK5 485 aa13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-202ENST00000583763 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms