RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNQ4P56696 695 aa22.01■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.01■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTC22Q5TAA0 569 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAMTA2O94983 1202 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 NLRP10Q86W26 655 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUP98P52948 1817 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDE1AP54750 535 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOXO4P98177 505 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPS6KA4O75676 772 aa21.96■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM37O94972 964 aa21.96■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPTP24298 496 aa21.96■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.96■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.96■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.95■■□□□ 1.11
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGL2O15211 777 aa21.95■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.95■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 MX1P20591 662 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 BCORQ6W2J9 1755 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM89AQ96GI7 184 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIL1Q9H173 461 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 COPRSQ9NQ92 184 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 POTEAQ6S8J7 498 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 C4BP0C0L5 1744 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNPATO15228 680 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 MSH5O43196 834 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 SDSP20132 328 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDC45O75419 566 aa21.91■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 PARP10Q53GL7 1025 aa21.91■■□□□ 1.1
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USP3-AS1-208ENST00000560962 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 EP400Q96L91 3159 aa21.89■■□□□ 1.1
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCN7AQ01118 1682 aa21.89■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 SASH1O94885 1247 aa21.89■■□□□ 1.09
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USP3-AS1-208ENST00000560962 CSF1RP07333 972 aa21.88■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 SUSD4Q5VX71 490 aa21.87■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYNE4Q8N205 404 aa21.87■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 AK7Q96M32 723 aa21.87■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.87■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLSCR1O15162 318 aa21.85■■□□□ 1.09
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USP3-AS1-208ENST00000560962 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.85■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.85■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 AOX1Q06278 1338 aa21.85■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.85■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDE8AO60658 829 aa21.85■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 AACSQ86V21 672 aa21.85■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.84■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 NTSR2O95665 410 aa21.84■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADRA2BP18089 450 aa21.84■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.84■■□□□ 1.09
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USP3-AS1-208ENST00000560962 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.84■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZPR1O75312 459 aa21.83■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTSWP56202 376 aa21.83■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TXNRD1Q16881 649 aa21.83■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.83■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 PROM2Q8N271 834 aa21.83■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 RILPL2Q969X0 211 aa21.83■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.83■■□□□ 1.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.83■■□□□ 1.08
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