RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CS-215ENST00000549143 CCDC87Q9NVE4 849 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-215ENST00000549143 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-215ENST00000549143 FOXO4P98177 505 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-215ENST00000549143 TFCP2Q12800 502 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-215ENST00000549143 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
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CS-215ENST00000549143 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
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CS-215ENST00000549143 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
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CS-215ENST00000549143 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
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CS-215ENST00000549143 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
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CS-215ENST00000549143 KIF2CQ99661 725 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 TTC41PQ6P2S7 1318 aa10.25□□□□□ -0.77
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CS-215ENST00000549143 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 IL15P40933 162 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 CTSWP56202 376 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-215ENST00000549143 CNNM1Q9NRU3 951 aa10.24□□□□□ -0.77
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