RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 GPATCH11Q8N954 259 aa10.04□□□□□ -0.8
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TRPS1-209ENST00000519674 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.03□□□□□ -0.8
TRPS1-209ENST00000519674 CXorf56Q9H5V9 222 aa10.03□□□□□ -0.8
TRPS1-209ENST00000519674 TOMM22Q9NS69 142 aa10.03□□□□□ -0.8
TRPS1-209ENST00000519674 RGPD2P0DJD1 1756 aa10.03□□□□□ -0.8
TRPS1-209ENST00000519674 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
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TRPS1-209ENST00000519674 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
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TRPS1-209ENST00000519674 NEK11Q8NG66 645 aa10.03□□□□□ -0.8
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TRPS1-209ENST00000519674 HMMRO75330 724 aa10□□□□□ -0.81
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TRPS1-209ENST00000519674 SMARCE1Q969G3 411 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 FUCA2Q9BTY2 467 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 SDSP20132 328 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.97□□□□□ -0.81
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