RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.51□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 IRS1P35568 1242 aa6.5□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 SPEM2Q0P670 501 aa6.5□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 DGKZQ13574 1117 aa6.5□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 GRIN2CQ14957 1233 aa6.5□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 PODNQ7Z5L7 613 aa6.5□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.5□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 COL26A1Q96A83 441 aa6.5□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 SLC30A3Q99726 388 aa6.5□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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CMC1-211ENST00000495428 BCS1LQ9Y276 419 aa6.5□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 SIN3BO75182 1162 aa6.49□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 AMPD1P23109 780 aa6.49□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 NEUROD1Q13562 356 aa6.49□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.49□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 SYT9Q86SS6 491 aa6.49□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.48□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 EPB42P16452 691 aa6.48□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 BTBD6Q96KE9 485 aa6.48□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.48□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.48□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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CMC1-211ENST00000495428 INPP5BP32019 993 aa6.47□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 IDH3AP50213 366 aa6.47□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 COX20Q5RI15 118 aa6.47□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 IFT43Q96FT9 208 aa6.47□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 EFCC1Q9HA90 598 aa6.47□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 RRAGCQ9HB90 399 aa6.47□□□□□ -1.37
CMC1-211ENST00000495428 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.46□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 ATP2B4P23634 1241 aa6.46□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 ARSDP51689 593 aa6.46□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.46□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 C16orf46Q6P387 395 aa6.46□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 CHSY3Q70JA7 882 aa6.46□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 ELOA3Q8NG57 546 aa6.46□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 TNFRSF25Q93038 417 aa6.46□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 MDFIQ99750 246 aa6.46□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.46□□□□□ -1.38
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CMC1-211ENST00000495428 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.46□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 ADAM23O75077 832 aa6.45□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 ALAS2P22557 587 aa6.45□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 BHMTQ93088 406 aa6.45□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.45□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 GSX2Q9BZM3 304 aa6.45□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.45□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.45□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 DGKGP49619 791 aa6.44□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 CCINQ13939 588 aa6.44□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.44□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.44□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.43□□□□□ -1.38
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CMC1-211ENST00000495428 OPLAHO14841 1288 aa6.43□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
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CMC1-211ENST00000495428 PNMA5Q96PV4 448 aa6.43□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
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CMC1-211ENST00000495428 GNB5O14775 395 aa6.42□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 MSTNO14793 375 aa6.42□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 ADH7P40394 386 aa6.42□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.42□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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CMC1-211ENST00000495428 SSFA2P28290 1259 aa6.4□□□□□ -1.38
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CMC1-211ENST00000495428 SEPT3Q9UH03 358 aa6.4□□□□□ -1.38
CMC1-211ENST00000495428 EGFRP00533 1210 aa6.39□□□□□ -1.39
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CMC1-211ENST00000495428 IGFLR1Q9H665 355 aa6.39□□□□□ -1.39
CMC1-211ENST00000495428 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.39□□□□□ -1.39
CMC1-211ENST00000495428 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.39□□□□□ -1.39
CMC1-211ENST00000495428 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CMC1-211ENST00000495428 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.39□□□□□ -1.39
CMC1-211ENST00000495428 USP20Q9Y2K6 914 aa6.39□□□□□ -1.39
CMC1-211ENST00000495428 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.39□□□□□ -1.39
CMC1-211ENST00000495428 M0R082 166 aa6.38□□□□□ -1.39
CMC1-211ENST00000495428 XYLBO75191 536 aa6.38□□□□□ -1.39
CMC1-211ENST00000495428 SASH3O75995 380 aa6.38□□□□□ -1.39
CMC1-211ENST00000495428 COL8A1P27658 744 aa6.38□□□□□ -1.39
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