RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 MYT1Q01538 1121 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 NFKBIBQ15653 356 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 CNTROBQ8N137 903 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 JCADQ9P266 1359 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.36■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 DDIT3P35638 169 aa24.36■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 SIL1Q9H173 461 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 NUP98P52948 1817 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.34■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 SGSM2O43147 1006 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 ANAPC15P60006 121 aa24.31■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 VPS72Q15906 364 aa24.31■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 IL25Q9H293 177 aa24.31■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.31■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 EVI5LQ96CN4 794 aa24.3■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.3■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 TNNI3KQ59H18 835 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 TFCP2Q12800 502 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 MYH3P11055 1940 aa24.28■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.28■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 GPR108Q9NPR9 543 aa24.28■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.27■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
NELFE-211ENST00000492185 CIAO1O76071 339 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 MCCP23508 829 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 HLFQ16534 295 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 RAD50Q92878 1312 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 ATP5JP18859 108 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 NLRP10Q86W26 655 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 IL27Q8NEV9 243 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.25■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 CSF1RP07333 972 aa24.25■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.25■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 SNRKQ9NRH2 765 aa24.25■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 FBXO3Q9UK99 471 aa24.25■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 HSPA4P34932 840 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 EYA2O00167 538 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 PALD1Q9ULE6 856 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.23■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 HIP1O00291 1037 aa24.23■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 ST18O60284 1047 aa24.23■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 SIK1P57059 783 aa24.23■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 NGLY1Q96IV0 654 aa24.23■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.23■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 PALLDQ8WX93 1383 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 ZNF609O15014 1411 aa24.22■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 C8orf37Q96NL8 207 aa24.21■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.21■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 ITPK1Q13572 414 aa24.21■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.21■■□□□ 1.47
NELFE-211ENST00000492185 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 FAM89AQ96GI7 184 aa24.2■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.2■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 ATP6V1AP38606 617 aa24.19■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.19■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 BCORQ6W2J9 1755 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 LRRC24Q50LG9 513 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 KCNB2Q92953 911 aa24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 428.9 ms