RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491706.5

MEIS1-211, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene MEIS1, Length 1,900 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-211ENST00000491706 SASH1O94885 1247 aa11.28□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 ZNF445P59923 1031 aa11.28□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 COPS6Q7L5N1 327 aa11.28□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 RASEFQ8IZ41 740 aa11.28□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 GPT2Q8TD30 523 aa11.28□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 DCAF5Q96JK2 942 aa11.28□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 CHAMP1Q96JM3 812 aa11.28□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 MRC1P22897 1456 aa11.27□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 CYP27B1O15528 508 aa11.27□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 GCKRQ14397 625 aa11.27□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa11.27□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 CADPS2Q86UW7 1296 aa11.27□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 TTC5Q8N0Z6 440 aa11.27□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 EVI5LQ96CN4 794 aa11.27□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 TTC14Q96N46 770 aa11.27□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 MYD88Q99836 296 aa11.27□□□□□ -0.6
MEIS1-211ENST00000491706 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.27□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.26□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 PTH1RQ03431 593 aa11.26□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.26□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 USP16Q9Y5T5 823 aa11.26□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 NASPP49321 788 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 AK2P54819 239 aa11.25□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 EPHA10Q5JZY3 1008 aa11.25□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.25□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 SIL1Q9H173 461 aa11.25□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 CPDO75976 1380 aa11.25□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 CABP4P57796 275 aa11.25□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 RUFY3Q7L099 469 aa11.25□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 KLHDC4Q8TBB5 520 aa11.25□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 KCNB2Q92953 911 aa11.25□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 HIP1O00291 1037 aa11.24□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 CASTP20810 708 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa11.24□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 CCDC171Q6TFL3 1326 aa11.24□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.24□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 MBD3O95983 291 aa11.23□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 CPA1P15085 419 aa11.23□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 TM6SF1Q9BZW5 370 aa11.23□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 FAM227BQ96M60 508 aa11.23□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 BOLA2Q9H3K6 86 aa11.23□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 COPRSQ9NQ92 184 aa11.23□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 SNRKQ9NRH2 765 aa11.23□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.23□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 COL15A1P39059 1388 aa11.22□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 CCDC173Q0VFZ6 552 aa11.22□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 NECTIN1Q15223 517 aa11.22□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 ADCK5Q3MIX3 580 aa11.22□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 VPS53Q5VIR6 699 aa11.22□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.22□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.22□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 PDRG1Q9NUG6 133 aa11.22□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.22□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 CREB3L3Q68CJ9 461 aa11.21□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.21□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 MAP4K1Q92918 833 aa11.21□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 FSD1Q9BTV5 496 aa11.21□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 RBSNQ9H1K0 784 aa11.21□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa11.21□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.21□□□□□ -0.61
MEIS1-211ENST00000491706 A0A0D9SFI3 127 aa11.21□□□□□ -0.62
MEIS1-211ENST00000491706 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.21□□□□□ -0.62
MEIS1-211ENST00000491706 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
MEIS1-211ENST00000491706 LARGE1O95461 756 aa11.21□□□□□ -0.62
MEIS1-211ENST00000491706 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
MEIS1-211ENST00000491706 KCNJ4P48050 445 aa11.21□□□□□ -0.62
MEIS1-211ENST00000491706 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
MEIS1-211ENST00000491706 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
MEIS1-211ENST00000491706 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
MEIS1-211ENST00000491706 BRINP3Q76B58 766 aa11.21□□□□□ -0.62
MEIS1-211ENST00000491706 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.21□□□□□ -0.62
MEIS1-211ENST00000491706 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
MEIS1-211ENST00000491706 SMC3Q9UQE7 1217 aa11.21□□□□□ -0.62
MEIS1-211ENST00000491706 GLI3P10071 1580 aa11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms