RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476510.5

GTPBP2-208, Transcript of GTP binding protein 2, human

TSL 5

Gene GTPBP2, Length 2,816 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP2-208	ENST00000476510	ITPK1	Q13572	414 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	TNS2	Q63HR2	1409 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	CDC45	O75419	566 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	VPS72	Q15906	364 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	AACS	Q86V21	672 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	SLIT2	O94813	1529 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	LRP6	O75581	1613 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	SASH1	O94885	1247 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	CLCN1	P35523	988 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	PALLD	Q8WX93	1383 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	TFCP2	Q12800	502 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	MTX1	Q13505	466 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	UTY	O14607	1347 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	GLI3	P10071	1580 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	CASP7	P55210	303 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510		H7C1W4	665 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	FOXO4	P98177	505 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP2-208	ENST00000476510	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	MRE11	P49959	708 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	IL25	Q9H293	177 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	GBP4	Q96PP9	640 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	ITGB4	P16144	1822 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	TIMM10	P62072	90 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	CASC1	Q6TDU7	716 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	PHF14	O94880	888 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	SNX21	Q969T3	373 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	CHGB	P05060	677 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	NRAP	Q86VF7	1730 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	KIF2C	Q99661	725 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	CHML	P26374	656 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	GREM2	Q9H772	168 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP2-208	ENST00000476510	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms