RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450444.5

TNS3-207, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TNS3, Length 1,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-207ENST00000450444 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 HSCBQ8IWL3 235 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 ERVV-1B6SEH8 477 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 H7C1W4 665 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 CDC45O75419 566 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 CASP7P55210 303 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 LY75O60449 1722 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 DDIT3P35638 169 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 FAM196AQ6ZSG2 479 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 RAB11FIP3O75154 756 aa16.08■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.08■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 ARXQ96QS3 562 aa16.08■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
TNS3-207ENST00000450444 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.08■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 APBB1O00213 710 aa16.08■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 TTC22Q5TAA0 569 aa16.08■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 KIF2CQ99661 725 aa16.08■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 LRRCC1Q9C099 1032 aa16.08■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 SURF6O75683 361 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 HLFQ16534 295 aa16.07■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa16.07■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.06■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa16.06■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 NUP98P52948 1817 aa16.06■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 OSBPL3Q9H4L5 887 aa16.05■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 NLRP10Q86W26 655 aa16.04■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 KIF1BPQ96EK5 621 aa16.04■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 BCORQ6W2J9 1755 aa16.04■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 CAMTA2O94983 1202 aa16.03■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 MCM4P33991 863 aa16.03■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 KCNQ4P56696 695 aa16.03■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.03■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 RHPN1Q8TCX5 695 aa16.03■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 EP400Q96L91 3159 aa16.03■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 FOXO4P98177 505 aa16.03■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 ERC1Q8IUD2 1116 aa16.03■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 ZNF34Q8IZ26 560 aa16.03■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 SALL3Q9BXA9 1300 aa16.02■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 CDHR2Q9BYE9 1310 aa16.02■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 GPTP24298 496 aa16.02■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TNS3-207ENST00000450444 RGL2O15211 777 aa16.01■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 RPS6KA4O75676 772 aa16.01■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.01■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 PLA2G12BQ9BX93 195 aa16.01■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 C4BP0C0L5 1744 aa16.01■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 UBN2Q6ZU65 1347 aa16.01■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 COPRSQ9NQ92 184 aa16.01■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 SCN7AQ01118 1682 aa16■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa16■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.153e-8■■□□□ 12.4
TNS3-207ENST00000450444 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 TRIM37O94972 964 aa15.99■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 PDE1AP54750 535 aa15.99■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 RABEP1Q15276 862 aa15.99■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 PARP10Q53GL7 1025 aa15.99■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 CASC1Q6TDU7 716 aa15.99■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.99■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 FAM89AQ96GI7 184 aa15.99■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 USP26Q9BXU7 913 aa15.99■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.99■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 DDX11L8A8MPP1 907 aa15.98■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.98■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 GNPATO15228 680 aa15.98■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 MX1P20591 662 aa15.98■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 PTMSP20962 102 aa15.98■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 STAP2Q9UGK3 403 aa15.98■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 AOX1Q06278 1338 aa15.97■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 SDSP20132 328 aa15.97■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.97■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 SASH1O94885 1247 aa15.96■□□□□ 0.15
TNS3-207ENST00000450444 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.5 ms