RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 NLRP10Q86W26 655 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 SLC16A10Q8TF71 515 aa26■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 FAM177BA6PVY3 158 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 GCKRQ14397 625 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 NEFLP07196 543 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 CRBNQ96SW2 442 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 SUSD4Q5VX71 490 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB7AO95365 584 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 TM4SF1P30408 202 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 GRM8O00222 908 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 SPON1Q9HCB6 807 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 LRP5O75197 1615 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 MYH3P11055 1940 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 MMP10P09238 476 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 MEIS3Q99687 375 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 USP44Q9H0E7 712 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 LAMB2P55268 1798 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 NPHP1O15259 732 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 DDR1Q08345 913 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 NYXQ9GZU5 481 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 MTFR1LQ9H019 292 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 NTSR2O95665 410 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 FAM89AQ96GI7 184 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 SERPINB2P05120 415 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 GNAI3P08754 354 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 H7C1W4 665 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 CNBD1Q8NA66 436 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 UTYO14607 1347 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXA4-202ENST00000428284 SYNE4Q8N205 404 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 CASP7P55210 303 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 ERFEQ4G0M1 354 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 ABCC12Q96J65 1359 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 POLD1P28340 1107 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 ST5P78524 1137 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 GNAI2P04899 355 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 SUCLG2Q96I99 432 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
HOXA4-202ENST00000428284 PTGER2P43116 358 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 KAZALD1Q96I82 304 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 PDE8AO60658 829 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 AAMPQ13685 434 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 CTSWP56202 376 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 FOXO4P98177 505 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 NLRP3Q96P20 1036 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXA4-202ENST00000428284 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 TAF1P21675 1872 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
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