RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 MMP10P09238 476 aa42.09■■■■■ 4.33
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CSNK1E-204ENST00000403904 CARMIL3Q8ND23 1372 aa42.07■■■■■ 4.33
CSNK1E-204ENST00000403904 GCKRQ14397 625 aa42.07■■■■■ 4.33
CSNK1E-204ENST00000403904 ITPRIPQ8IWB1 547 aa42.07■■■■■ 4.33
CSNK1E-204ENST00000403904 COL24A1Q17RW2 1714 aa42.07■■■■■ 4.33
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CSNK1E-204ENST00000403904 C10orf71Q711Q0 1435 aa41.74■■■■■ 4.27
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CSNK1E-204ENST00000403904 ANKRD44Q8N8A2 993 aa41.69■■■■■ 4.26
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CSNK1E-204ENST00000403904 PDE6BP35913 854 aa41.68■■■■■ 4.26
CSNK1E-204ENST00000403904 TTLL11Q8NHH1 800 aa41.68■■■■■ 4.26
CSNK1E-204ENST00000403904 KLHL34Q8N239 644 aa41.67■■■■■ 4.26
CSNK1E-204ENST00000403904 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
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CSNK1E-204ENST00000403904 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
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