RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380776.4

KCNQ1-204, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-204ENST00000380776 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.42□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 ARXQ96QS3 562 aa8.42□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 NHSQ6T4R5 1651 aa8.42□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 RREB1Q92766 1687 aa8.41□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.41□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 IL27Q8NEV9 243 aa8.41□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 REC8O95072 547 aa8.4□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 BECN1Q14457 450 aa8.4□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC57Q2TAC2 916 aa8.4□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 LMBR1LQ6UX01 489 aa8.4□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 NLRP10Q86W26 655 aa8.4□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 TICAM2Q86XR7 235 aa8.4□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 CNTROBQ8N137 903 aa8.4□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 KAZALD1Q96I82 304 aa8.4□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 GPR108Q9NPR9 543 aa8.4□□□□□ -1.06
KCNQ1-204ENST00000380776 HIP1O00291 1037 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 KCNQ2O43526 872 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 PDE8AO60658 829 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 CIAO1O76071 339 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF34Q8IZ26 560 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 ECHDC1Q9NTX5 307 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 RPS6KA4O75676 772 aa8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 CAMTA2O94983 1202 aa8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 CSF1RP07333 972 aa8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 ADRA2BP18089 450 aa8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 SDSP20132 328 aa8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 FOXO4P98177 505 aa8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 ITPK1Q13572 414 aa8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 BTAF1O14981 1849 aa8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 NUP98P52948 1817 aa8.38□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 SH3TC1Q8TE82 1336 aa8.37□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.37□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.37□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 EYA2O00167 538 aa8.37□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 HLFQ16534 295 aa8.37□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 AACSQ86V21 672 aa8.37□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.37□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 NYXQ9GZU5 481 aa8.37□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.37□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 SBF2Q86WG5 1849 aa8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 ZPR1O75312 459 aa8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 SASH1O94885 1247 aa8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 MCCP23508 829 aa8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 CTSWP56202 376 aa8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 RILPL2Q969X0 211 aa8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 EVI5LQ96CN4 794 aa8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 FAM89AQ96GI7 184 aa8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 BCL11AQ9H165 835 aa8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 SIL1Q9H173 461 aa8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 NARFQ9UHQ1 456 aa8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 LY75O60449 1722 aa8.35□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 GPTP24298 496 aa8.35□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC152Q4G0S7 254 aa8.35□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 TNNI3KQ59H18 835 aa8.35□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.35□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
KCNQ1-204ENST00000380776 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms